CCA (Canonical Correlation Analysis) の例 (R, CCA パッケージを使用)

前準備

R システムのインストール

• Windows での R システムのインストール: 別ページ »で説明している．
• Ubuntu での R システムのインストール: 別ページ »で説明している．

CCA パッケージのインストール

R システムで，次のコマンドを実行し，インストールする．

このとき「Secure CRAN mirrors」のような，ミラーサイトの選択画面が出たときは「Japan」のものを選ぶ．

install.packages("CCA") 

使ってみる

1. R の起動
   
2. library(CCA) の実行

   library(CCA)
   

   
3. データの準備，

   ここでは，iris を使う．

   data(iris)
   a <- iris[1:4]
   

   
4. データの統計情報

   stats(a)
   

   
5. correlation

   下記の操作手順例では、ベクトルのデータ X とベクトルのデータ Y の correlation を求めている

   X <- a[,1:2]
   Y <- a[,3:4]
   matcor(X, Y)
   

   
6. CCA の計算

   cc1[1] は canonical correlations, cc1[3:4] は canonical coefficients

   cc1 <- cc(X,Y)
   cc1[1]
   cc1[3:4]
   

   
7. canonical loadings の計算

   cc2 <- comput(X, Y, cc1)
   cc2[3:6]