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ImageJ 1.53 のインストール，ImageJ の主な機能（Windows 上）

【要約】 ImageJ 1.53のインストールと主な機能について．ImageJはオープンソースのJavaソフトウェアであり，ファイルの読み書き，画像表示，選択，画像フィルタ，幾何演算，解析，編集，色処理などの機能を提供している．ImageJのページからダウンロードし，展開することで使用できる．スライス表示や断面表示，ファイルの読み込みや書き出しなど，様々な機能を利用することができる．また，ImageJのプラグインを追加することでさらなる機能拡張が可能である．ファイルの読み込みや書き出し，スライス表示，断面表示などの操作方法も説明．

URL: https://imagej.nih.gov/ij/

ファイル読み書き: Anaylze, TIFF, raw, GIF, JPEG, BMP, PNG, PGM, FITS など多数（プラグインの追加インストールにより種類が増える）
画像表示
選択：　領域指定，線，点
画像フィルタ：スムーシング (smoothing), 鋭敏化 (sharpening), エッジ検出 (edge detection), メディアン・フィルタ (median filtering), しきい値処理，対話的な輝度とコントラストの調整
幾何演算：切り出し (crop), サイズ変更 (resize), 回転 (rotate), フリップ (flip)
解析：選択領域の面積，平均、標準偏差、最小、最大．　長さ．角度．密度尺度を用いた調整．ヒストグラム
編集：カット，コピー，ペースト，AND, OR, NOT．テキスト，矢印，矩形，楕円，多角形の描画
色処理： RGB成分，HSV 成分、カラーパレット

など

ImageJ のインストール手順（Windows 上）

ImageJ のページを確認する．
https://imagej.nih.gov/ij/index.html
「Download」をクリック
Windows の下の「ImageJ bundled with 64-bit Java 8」をクリック
ダウンロードが始まる．
ダウンロードした .zip ファイルを展開（解凍）する．

Windows での展開（解凍）に便利な 7-Zip: 別ページ »で説明
試しに起動してみる

ImageJ で「メモリが足りない」というエラーがでたときの対処

Imagej.cfg を編集する

[image]

ImageJ の主な機能

ImageJ の数多くの機能のうち，次の機能を紹介する．

スライス表示
断面表示
ファイルの読み込み
ファイルの書き出し

ファイルの読み込み

「File」→「import」と操作する
その後，画像の種類を選ぶ．
画像ファイルを選ぶ
スライス表示の画面が現れるので確認する．

ファイルの読み込み（連番画像の場合）

「File」→「import」→「image Sequence」と操作する
ディレクトリを指定
同じディレクトリには，連番画像以外の画像ファイルを置いておかないこと
スライス表示されるので確認する

スライス表示

ファイルを読み込むとスライス表示される．下のスライドバーで表示すべきスライスを変えることができる．

[image]

ファイルの書き出し

「File」→「Save As」と操作する
そして，画像の種類を選ぶ．
画像ファイル名を指定する

ファイルの書き出し（連番画像の場合）

「File」→「Save As」→「Image Sequence」と操作する
ディレクトリ，ファイル名，画像の種類などを設定する

断面表示

ImageJ で「Plugins」→「3D」→「」と操作する
設定
断面表示される．マウス等を使い操作できる．

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