医用画像診断支援共通�EラチE��フォーム�E�ELUTO�E��Eインスト�Eル�E�データの読み込み�E�レンダリング�E�Eindows 上！E

PLUTOのインスト�Eル手頁E

ここではバ�Eジョン0.9.8をダウンロードし、インスト�Eルを行う手頁E��示す、E

1. PLUTO の Web ペ�Eジを開ぁE

   http://pluto.newves.org �E�現存しなぁE��E

2. そ�E後，ダウンロード�Eージに進む
3. ユーザ登録を行う

   メールによりダウンロード�EージのURLが送られてくる。そのURLよりファイルをダウンロードする、E

4. URLよりダウンロードしたファイルを，�EかりめE��ぁE��ィレクトリに展開することでインスト�Eルが完亁E��る、E

PLUTOの起動方況E

1. チE��クトップに展開されたディレクトリ冁E��あるチE��レクトリ 、Estrong>x86、Eまた�E、Estrong>x64」を開く
2. ファイル「Pluto.exe」を実行すめE

   次のウインドウが立ち上がれ�EPLUTOが正しく実行されてぁE��、E

   
   図�E�PLUTOの実行画面

ここで用ぁE��画僁E

• CT画像！EGBカラーBMP画像！E
• CT画像から臓器領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像！E
• MRA画像！EGBカラーBMP画像！E
• MRA画像から血管領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像！E

臓器領域と血管領域は、CT画像とMRA画像�E臓器の輪郭を粘性流体位置合わせで補正済みである�E�E

図�E�臓器と血管の3次允E��体地図を統合しぁE次允E��体地図

画像データファイル形弁E

画像�E�E�E種類ともRGBカラーのBMP形式�E断面画僁E687枚である�E�臓器領域�E�血管領域を抽出したチE�EタめE687枚�E断面画像である�E�これら�E�臓器領域�E�血管領域を抽出したチE�Eタを重ねあわせて�E�E次允E��示を行うことをPLUTOを用ぁE��行う�E�E

• 臓器領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像）�EチE��レクトリ�E�仮にC:/segmentation_data とする
• 血管領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像）�EチE��レクトリ�E�仮にC:/vessel とする

RGBカラーBMP画像�EPLUTO対応形式への変換手頁E

PLUTO対応形式には�E�DICOMとRAW形式がある。ここでは�E�取り扱ぁE��簡便なRAW形式に変換を行うこととする。RAW形式�Eヘッダが存在せず、E�E列に固定長のチE�Eタを�EれてぁE��も�Eである、E

1. 臓器領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像）�E�E�E56色グレイスケールBMP画像への変換

   まず、臓器領域を抽出したチE�Eタ�E�EGBカラーBMP画像）を�E�E56色グレイスケールBMP画像に変換するプログラムを作�Eし、カラー画像を256色グレイスケール画像に変換する。なぜ専用のプログラムを作�EしたかとぁE��と、臓器のRGB値を足して3で割る通常のグレイスケール値に変換するも�Eを利用すると、褁E��の臓器が同じ値に変換されてしまぁE��めである。このプログラムは予め臓器の色を取得しており、その数値を�Eに、E56色中の別、E�E色に割り当てる。臓器の色は18色あり、それぞめE0、E0・・・180までの18通りの色に置き換えてぁE��。背景色(R,G,B)=(255,255,255)は190に置き換えてぁE��、E 　　　

   
   
   図�E�変換前�ERGBカラーBMP画像と変換後�E256色グレイスケールBMP画僁E

   clear all;
   cd "C:/ "
   %臓器のRGB値
   col=[0 0 0;0 0 255;0 128 255;0 151 0;17 177 255;74 255 255;128 0 64;128 64 0;128 128 0;128 128 255;157 255 255;204 0 204;242 0 121;255 0 255;255 47 47;255 74 255;255 128 128;255 164 119;255 255 255];
   for i=10:10:1687
   file_name=strcat("segmentation_data/zouki_0",dec2base(i,10,4),".bmp");
   tmp_=imread(file_name);
   if(size(size(tmp_))(2)!=3)
   tmp=zeros(265,490,3);
   else
   tmp=tmp_;
   endif
   tmp2=zeros(265,490);
   for j=1:490
   for k=1:265
   for l=1:size(col)(1)
   if(reshape(tmp(k,j,:),1,3)==col(l,:))tmp2(k,j)=l*10;
   endif
   end
   end
   end
   imwrite(tmp2/255,strcat("C:/PLUTO/zouki_gray_0",dec2base(i,10,4),".bmp"));
   end
   

   
   カラー画像をグレイスケール画像に変換するプログラム
2. 臓器領域�E�血管領域を抽出したチE�Eタの統吁E/strong>

   次に、臓器領域�E�血管領域を抽出したチE�Eタを統合する�Eログラムを使ぁE��これ�E、血管の数値を臓器の画像に上書きする�Eログラムである。次に、統合したRBGカラーの490x265の画僁E687枚を1つの配�Eの大きさぁEbit Unsigned IntegerとなるよぁE��490x265x1687のRAW形式�EチE�Eタに変換する。RBGカラーの臓器と血管を統合した画像を256色の色にマッピングを行うOctaveのプログラムを使ぁE��血管の色は200に置き換えてぁE��、E 　　　

   こ�E結果�E�この連番画像�E256色グレイスケールBMP画像�E連番ファイルであり、臓器の色ぁE0、E0、�E・・180までと多色で構�Eされており、血管ぁE00、背景色ぁE90となってぁE��、E

   
   
   図�E�結合前�E血管画像と、統合しぁE次允E��体地図の画僁E

   clear all;
   cd "C:/ "
   
   for i=1:1687
   file_name=strcat("PLUTO/zouki_gray_0",dec2base(i,10,4),".bmp");
   file_name2=strcat("vessel/out",dec2base(i,10,4),".bmp");
   tmp_1=imread(file_name);
   tmp_2=imread(file_name2);
   if(size(size(tmp_1))(2)==3)
   tmp1=tmp_1(:,:,1);
   else
   tmp1=tmp_1;
   endif
   if(size(size(tmp_2))(2)==3)
   tmp2=tmp_2(:,:,1);
   else
   tmp2=tmp_2;
   endif
   tmp2=double(tmp2)*1000+1;
   tmp3=uint8(tmp1./tmp2);
   if(max(max(tmp2))>0)
   tmp1=uint8(tmp2./max(max(tmp2))*200+tmp3);
   endif
   imwrite(tmp1,strcat("統合した人体地図/fluid2_",dec2base(i,10,4),".bmp"));
   end
   

   
   図�E�臓器と血管のグレイスケール画像を統合する�Eログラム

   そして、臓器と血管を統合しぁE56色グレイスケールBMPを画像変換ソフトBatch goo!を用ぁE��256色tiff形式に変換する、Eatch goo!は下記�EURLからダウンロードできる、E

   http://www.vector.co.jp/download/file/win95/art/fh512252.html

   
   図�E�Batch goo!の動作画面

   最後に、MRICROを用ぁE��TIFF画像をアナライズフォーマット！Ehdr+.img�E�形式に変換する。この.imgファイルがPLUTOで読み込むことができるRAW形式�Eファイルに当たる、ERICROを起動し、Convert Foreign to Analyzeを用ぁE��画像�E枚数1687を�E力し、下図の手頁E��TIFFファイルfluid2_0001.tiffを選択し、fluid2_0001.hdrファイルに変換する、E

   
   
   
   
   
   
   図�E�MRICROでTIFFファイルを変換する手頁E
   
   図�E�MRICROで変換したアナライズフォーマット�E画像を縦断面で表示した画僁E

   3次允E��体地図をPLUTOで読み込ませる

   PLUTOで「開く�ERAWチE�Eタを開く」を選択する。ファイルの種類を「�Eてのファイル(*.*)」を選び、fluid2_0001.imgファイルを選択する。画像サイズをWidthに490、Heightに265、Depthに1687を設定し、�EクセルサイズをResoXに1めEResoYに1めEResoZに0.98を設定し、データタイプにuchar、エンチE��アンにリトルを設定してOKを押す、E

   
   
   
   図�E�PLUTOでRAWチE�Eタを開く手頁E

3次允E��体地図の表示の調整�E�透過度の設定につぁE���E�E

読み込ませただけではカメラ位置が近いため何も刁E��らなぁE��像である、E

図�E�読み込ませた後�E画僁E

マウスの右クリチE��を押しながら右にドラチE��することでカメラを遠ざけることができ、立方体が表示される。左クリチE��を押しながらドラチE��することで、立方体を回転させることで調節した画像が下図である、E

図�E�カメラを遠ざけ、立方体を回転させ立方体�E位置を調節

次に、この画像�E描画方法を変更する、ET用カラーチE�Eブルからマ�Eク用カラーチE�Eブルを使用するように設定する。右下�E画像データの真ん中のボタンを押し、一番右にある丸ぁE��イコンをクリチE���E�E

図�E��Eーク用カラーチE�Eブルを使用するように設定を変更

次に、E��過度を設定する。�Eーク用カラーチE�EブルをクリチE���E�E

図�E��Eーク用カラーチE�EブルをクリチE��

そしてマ�Eク用カラーチE�Eブル下�Eバ�Eを右に伸ばし、E��から２５５まで表示するようにする、E

図�E�E55色全てを表示するよう下�Eバ�Eを右まで伸ばした画僁E

そ�E後、Eにカーソルを合わせて左クリチE��し、E55までドラチE��すると、不透�E度を変更できるウインドウが表示される�Eで、不透�E度のバ�EめE%に設定する、E

図�E��Eての色につぁE��透�E度を設宁E

そして、背景の値190を無効にする、E90の透�E度めEにしても同じ画像が得られるため、どちらを行っても良ぁE��E

図�E�背景色を描画しなぁE��ぁE��効にする

レンダリング解像度めE024にすることで、下図のような高解像度の画像が得られる。ただし、E024だと角度を変えるたびに再計算して描画するため表示までの時間がかかる。そのため、カメラの角度めE��置を調整する場合にはレンダリング解像度は256のままで行う方が効玁E��く作業を行うことができる。ただし、このマ�Eク用カラーチE�Eブルは一度ランダムに色を�E設定した後で撮影を行ってぁE��ため、同じ色で表示されることは保障しなぁE��同じよぁE��色合いの画像にしたぁE��合�E、各臓器の色を左クリチE��で再設定することでこれと近い画像にすることは可能である、E

図�E�E次允E��体地図をPLUTOで表示した結果