ビジュアライゼーションツールキット VTK 9 (最新版)のインストール(Ubuntu 上)
URL: https://vtk.org/
このページでは,Git リポジトリのソースコード(開発版)をビルドしてインストールする. リリース版(9.6 系)のソースコードは https://vtk.org/download/ から入手できる.
ソフトウェア等の利用条件は,利用者自身で確認下さい.
前準備
Ubuntu のシステム更新
Ubuntu で OS のシステム更新を行うときは, 端末で,次のコマンドを実行する。これは、パッケージ情報を最新の状態に保ち、インストール済みのパッケージをセキュリティアップデートやバグ修正を含めて更新するためである。
# パッケージリストの情報を更新
sudo apt update
# インストール済みのパッケージを包括的に更新 (依存関係も考慮)
sudo apt full-upgrade
# カーネル更新等で実際に再起動が必要な場合のみ実行を推奨
# sudo shutdown -r now
C/C++ コンパイラー,make,パッケージツール,その他のインストール
端末で,次のコマンドを実行する.
# パッケージリストの情報を更新
sudo apt update
sudo apt -y install build-essential gcc g++ make libtool texinfo dpkg-dev pkg-config
sudo apt -y install git
CMake と OpenGL 開発ファイルのインストール
VTK のビルドには CMake 3.13 以上が必要である. Ubuntu 22.04 以降では,apt でインストールされる CMake がこの条件を満たす. 端末で,次のコマンドを実行する.
# パッケージリストの情報を更新
sudo apt update
sudo apt -y install cmake cmake-curses-gui ninja-build
sudo apt -y install mesa-common-dev mesa-utils libgl1-mesa-dev libxt-dev freeglut3-dev
cmake --version
ビジュアライゼーションツールキット VTK 9 (最新版)のインストール(Ubuntu 上)
端末で,次のコマンドを実行する.
ソースコードをダウンロードして,インストールしている. VTK はソースディレクトリ内でのビルド(in-source build)に対応していないため, ソースディレクトリとは別のビルドディレクトリを使う.
- 端末で,次のコマンドを実行する.
cd /tmp rm -rf VTK VTK-build git clone --recursive https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk.git VTK cmake -S /tmp/VTK -B /tmp/VTK-build -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release cmake --build /tmp/VTK-build -j$(nproc) sudo cmake --install /tmp/VTK-build
(以下省略) - インストール終了の確認
エラーメッセージが出ていないことを確認する.
- インストールされたバージョンの確認
CMake の設定ファイルが置かれたディレクトリ名で,バージョンを確認できる. このディレクトリは,あとで VTK_DIR に指定する.
ls -d /usr/local/lib/cmake/vtk-*
共有ライブラリの設定
VTK の共有ライブラリは /usr/local/lib にインストールされる. このディレクトリは Ubuntu の既定の設定(/etc/ld.so.conf.d/libc.conf)に含まれているが, キャッシュを更新するため,次のコマンドを実行する.
sudo ldconfig
/usr/local/lib が探索対象になっていることの確認は,次のコマンドで行う.
ldconfig -v 2>/dev/null | grep '^/usr/local/lib'
VTK データのダウンロード
サンプルプログラムで使うデータは,VTK の公式サイトから入手する. 端末で,次のコマンドを実行する.
cd /tmp
wget https://vtk.org/files/release/9.6/VTKDataFiles-9.6.2.tar.gz
tar -xzf VTKDataFiles-9.6.2.tar.gz
# 医用画像データ (headsq) の場所を確認
find /tmp -type d -name headsq
VTK サンプルプログラムのテスト実行
次の手順で,多数のサンプルプログラムのうち Medical をビルドし,実行する. VTK_DIR には,前の手順で確認したディレクトリ(例:/usr/local/lib/cmake/vtk-9.6)を指定する.
cd /tmp/VTK/Examples/Medical/Cxx
cmake -S . -B build -DVTK_DIR=/usr/local/lib/cmake/vtk-9.6
cmake --build build -j$(nproc)
# 「find /tmp -type d -name headsq」で確認したディレクトリを指定する
./build/bin/Medical1 /tmp/VTKDataFiles-9.6.2/Data/headsq/quarter
このプログラムは,大きさ 64x64,16 ビットの連番の Raw データ quarter.1〜quarter.93 を読み込み, 等値面の値 500(皮膚に対応する値)で等値面を生成して描画する.
マウスを使って,回転や拡大縮小ができる.
Medical1.cxx の skinExtractor->SetValue(0, 500); を skinExtractor->SetValue(0, 1200); に書き換えて再ビルドすると, より高い値(骨に対応する値)の等値面が生成され,次のように表示される.