Anaconda 3 で各種パッケージのインストール，SWIG の利用，Python 2.7 仮想環境の作成（Ubuntu 上）

前準備

1. 前準備として Anaconda がインストール済みであること
2. Anaconda3 の conda パッケージの更新、古い conda パッケージファイルの削除

   「conda config --remove channels conda-forge」は，conda のチャンネルに「conda-forge」が入っていたら削除する操作．「CondaKeyError: 'channels' 'conda-forge' ...」というエラーメッセージは無視してよい．

   conda config --remove channels conda-forge
   conda upgrade -y --all
   conda clean -y --packages
   

   

   （途中省略）

   

   （途中省略）

   

各種パッケージのインストール

Anaconda では，「conda」という形式の Python のパッケージも、簡単に扱うことができる． Python のパッケージを追加することで，Python にいろいろな機能を追加することができる．conda を用いてPythonパッケージ以外のソフトウェアをインストールすることもできる

端末で，次のコマンドを実行する．

CONDAPKGS="tensorflow-gpu tensorflow-datasets matplotlib numpy scipy h5py scikit-learn scikit-image seaborn pandas pandasql pillow pytest pyyaml cython bokeh keras statsmodels plotly sympy csvkit docopt pyproj flake8 protobuf pymc3 bs4 html5lib rope wrapt mkl mkl-include cffi wheel six holoviews jupyterlab jupyter spyder sphinx bottleneck pygments numexpr xlrd xlsxwriter lxml graphviz pydot flask django redis pylint bz2file PyOpenGL"
for i in $CONDAPKGS; do
    echo $i
    conda install -y $i > /dev/null
done

conda install -c conda-forge -y opencv
conda config --remove channels conda-forge

SWIG を使ってみる

1. SWIG のインストール (Install swig)

   sudo apt -y update
   sudo apt -y install swig
   

   
2. プログラムファイルの作成

   http://www.swig.org/Doc1.3/Python.html#Python_nn6 に記載のサンプルプログラム

   • example.i

     %module example
     
     %{
     #define SWIG_FILE_WITH_INIT
     #include "example.h"
     %}
     
     int fact(int n);
     

   • example.c

     #include "example.h"
     
     int fact(int n) {
         if (n < 0){ /* This should probably return an error, but this is simpler */
             return 0;
         }
         if (n == 0) {
             return 1;
         }
         else {
             /* testing for overflow would be a good idea here */
             return n * fact(n-1);
         }
     }
     

   • example.h

     int fact(int n);
     

   • setup.py

     #!/usr/bin/env python
     
     """
     setup.py file for SWIG example
     """
     
     from distutils.core import setup, Extension
     
     
     example_module = Extension('_example',
                                sources=['example_wrap.c', 'example.c'],
                                )
     
     setup (name = 'example',
            version = '0.1',
            author      = "SWIG Docs",
            description = """Simple swig example from docs""",
            ext_modules = [example_module],
            py_modules = ["example"],
            )
     

3. プログラムファイルから、Python で実行可能にするためのファイルを作る

   swig -python example.i
   python setup.py build_ext --inplace
   ls -la example.* build 
   

   
4. python 処理系を起動し、次のプログラムを試してみる

   import example
   example.fact(4)
   exit()
   

   

隔離された Python 2.7 環境の作成 （condaを使用）

1. 今から作成するPython の仮想環境の名前と、Pythonのバージョンを決めておく
   • Python の仮想環境の名前: py27
   • Pythonのバージョン: 2.7
2. 端末を開く
3. Python の仮想環境を作成する

   端末で，次のコマンドを実行する．

   「Proceed ([y]/n) ?」 に対しては Enterキー

   conda create -n py27 python=2.7
   

   
   （以下省略）
4. Python 環境が作成できたことを確認

   conda info -e
   

   

これで、もとからの Python 環境と， 新規作成されたPython 環境（Python のバージョン 2.7，名前は py27）の共存できた。

隔離された Python 2.7 環境で各種パッケージのインストール

Anaconda 既定のときと比べると、最初に「source activate py27」を実行するだけの違い

conda-build パッケージのインストール

conda-buildパッケージは，condaパッケージを自前で作成するなどが簡単にできるためのツール．

1. まずは，最新の conda-build パッケージが欲しい．

   新しく端末を開き，次のコマンドを実行する．

   activate py27
   conda install -y conda-build
   

   

   * 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら， y + Enter で続行する．「反応が遅いなあ」と思ったら、Enter キーを押してみる．

2. setuptools, conda, conda-build の更新

   conda update -y setuptools
   conda update -y conda
   conda update -y conda-build
   

   

   * 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら， y + Enter で続行する．「反応が遅いなあ」と思ったら、Enterキーを押してみる．

3. gcc_linux, gxx_linux のインストール・インストール済みパッケージの更新

   conda install -y gcc_linux-64
   conda install -y gxx_linux-64
   conda update -y --all