JRuby から R の機能を呼び出す (rsruby を使用)

rsruby のインストール (Install rsruby)

Ubuntu でのインストール手順 (Install rsruby on Ubuntu System)

1. Ubuntu で Ruby 処理系のインストール
2. Ubuntu で R 処理系のインストール
3. JRuby のインストール

   ◆ rbenv を使う場合の実行手順例

   rbenv install --list
   rbenv install jruby-1.6.8
   rbenv global jruby-1.6.8
   rbenv rehash
   

4. gem を用いて rsruby のインストール

   sudo gem install --include-dependencies rsruby  -- --with-R-dir=/usr/lib/R --with-R-include=/usr/share/R/include --with-opt-dir=/usr/share/R
   

試しに使ってみる (Try to use rsruby)

Ruby から R の機能を呼び出す例 (invoke R functions from Ruby)

R システムを呼び出して，CSV ファイルの読み込みと散布図の描画を行ってみる．ここでの テスト用データは，「データフレームからの散布図作成，画像ファイルに保存（R システム，ggplot，plot を使用）」に記述している Book1.csv を使っています

◆ Ubuntu の場合の実行手順例

1. Book1.csv をダウンロードし /tmp に置く
2. 端末を開き、次のように実行してみる

   【関連する外部ページ】 https://kenai.com/projects/jruby/pages/PerformanceTuning

   export R_HOME=/usr/lib/R
   ulimit -s unlimited
   irb 
   require 'rubygems'
   require 'rsruby'
   r = RSRuby::instance
   r.eval_R(<<-RCOMMAND)
     X <- read.table("/tmp/Book1.csv", header=TRUE, sep=",", na.strings="NA", dec=".", strip.white=TRUE);
     plot( X[,c("seq")], X[,c("USD")] )
     pdf("hoge.pdf")
     plot( X[,c("seq")], X[,c("USD")] )
     dev.off()
   RCOMMAND
   

3. 実行結果の例
   
   

Ruby から R に配列データを渡す (pass an array date as an argument from Ruby to R)

Ruby で連想配列を作り，それを R に渡して，散布図を書く．

◆ Ubuntu の場合の実行手順例

export R_HOME=/usr/lib/R
ulimit -s unlimited
irb

require 'rubygems'
require 'rsruby'

D = { "a"=>[1, 2, 3, 4, 5], "b"=>[100, 110, 105, 120, 125] }
r = RSRuby::instance
r.eval_R(<<-RCOMMAND)
# write a graph in a window 
     A <- matrix( c( #{D["a"].join(",")} ), 1, #{D["a"].size} )
     B <- matrix( c( #{D["b"].join(",")} ), 1, #{D["b"].size} )
     plot(A, B)
# write a graph in a PDF file
     pdf("result.pdf", paper="a4")
     A <- matrix( c( #{D["a"].join(",")} ), 1, #{D["a"].size} )
     B <- matrix( c( #{D["b"].join(",")} ), 1, #{D["b"].size} )
     plot(A, B)
     dev.off()
RCOMMAND