pyenvは,Python をインストールするのに便利なツールである. システムの Python とPython の仮想環境の作成と利用が簡単にできる機能もある. Anaconda は,Python バージョン 3 の言語処理系と,開発環境 (Jupyter ノートブック (Jupyter Notebook), Spyder) と,各種ツールの詰め合わせである.
ここで行うこと.
pyenv をインストールする.pyenv の配下に Anaconda 5.3.0 (Python 3.6 同封)、Python 2.7.15 をインストールする.それらにパッケージを追加する.
【目次】
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UbuntuUbuntu で OS のシステム更新を行うときは, 端末で,次のコマンドを実行する.
sudo apt -y update sudo apt -yV upgrade sudo /sbin/shutdown -r now
インストールするには,端末で,次のコマンドを実行する.
sudo apt -y install build-essential gcc g++ make libtool texinfo dpkg-dev pkg-config
端末で,次のコマンドを実行する.
sudo apt -y update sudo apt -y install --no-install-recommends make build-essential libssl-dev zlib1g-dev libbz2-dev libreadline-dev libsqlite3-dev wget curl llvm libncurses5-dev xz-utils tk-dev libxml2-dev libxmlsec1-dev libffi-dev liblzma-dev
cd /tmp git clone https://github.com/pyenv/pyenv.git ~/.pyenv
cd ~/.pyenv git pull
echo 'export PYENV_ROOT="${HOME}/.pyenv"' >> ~/.bashrc echo 'if [ -d "${PYENV_ROOT}" ]; then' >> ~/.bashrc echo ' export PATH=${PYENV_ROOT}/bin:$PATH' >> ~/.bashrc echo ' eval "$(pyenv init -)"' >> ~/.bashrc echo 'fi' >> ~/.bashrc exec $SHELL -l
pyenv rehash pyenv install -l
pyenv install -l | grep anaconda
sudo apt -y update sudo apt -y install libbz2-dev libsqlite3-dev libssl-dev libreadline-dev libpng-dev libjpeg-dev zlib1g-dev libx11-dev libfreetype6-dev
下の実行例では anaconda3-5.3.0 をインストールしている
pyenv install anaconda3-5.3.0
pyenv versions
「anaconda3-5.3.0」がインストールされたことが分かる
「pyenv shell anaconda3-5.3.0」は、anaconda3-5.3.0 のPythonの使用を開始するためのコマンド
pyenv shell anaconda3-5.3.0 python print(1 + 2) exit()
pyenv shell anaconda3-5.3.0 spyder
spyder の画面が開くことを確認する
Ubuntu 18.04 での実行結果の例
pyenv rehash pyenv install -l
pyenv install -l | grep 2.
pyenv install 2.7.15
pyenv versions
複数のPython がインストールされていることが分かる。
使用する Python の切り替えは 次のコマンドで行う
pyenv shell 2.7.15 python print(1 + 2) exit() pyenv shell anaconda3-5.3.0 python print(1 + 2) exit()
echo 'pyenv shell 2.7.15' >> ~/.bashrc exec $SHELL -l
echo 'pyenv shell anaconda3-5.3.0' >> ~/.bashrc exec $SHELL -l
ls ~/.pyenv/versions
which pip which easy_install
pyenv shell 2.7.15 which pip which easy_install pip list
pyenv shell anaconda3-5.3.0 which pip which easy_install pip list
※ conda-buildパッケージは,condaパッケージを自前で作成するなどが簡単にできるためのツール.
pyenv shell anaconda3-5.3.0 conda install -y conda-build
※ 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら, y + Enter で続行する.「反応が遅いなあ」と思ったら、Enter キーを押してみる.
cd /tmp sudo rm -f get-pip.py curl -O https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py python get-pip.py
conda update -y setuptools conda update -y conda conda update -y conda-build
※ 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら, y + Enter で続行する.「反応が遅いなあ」と思ったら、Enterキーを押してみる.
conda install -y gcc_linux-64 conda install -y gxx_linux-64 conda update -y --all
Anaconda では,「conda」という形式の Python のパッケージも、簡単に扱うことができる. Python のパッケージを追加することで,Python にいろいろな機能を追加することができる.conda を用いてPythonパッケージ以外のソフトウェアをインストールすることもできる
端末で,次のコマンドを実行する.
pyenv shell anaconda3-5.3.0 conda install -y numpy conda install -y six conda install -y protobuf conda install -y pillow conda install -y hdf5 conda install -y h5py conda install -y chainer # conda install -y scikit-learn conda install -y scikit-image conda install -y matplotlib conda install -y seaborn conda install -y graphviz conda install -y pydot conda install -y yaml conda install -y flask conda install -y django conda install -y sympy conda install -y pandas conda install -y sqlite conda install -y redis conda install -y scipy conda install -y gensim conda install -y opencv conda install -y pylint conda install -y bz2file conda install -y PyOpenGL conda install -y ipykernel # pip install ... か github を使うもの # 最初の conda ... は、下の pip でいれているものの前提ソフトウェア conda install -y termcolor astor wheel setuptools six protobuf werkzeug markdown absl-py grpcio gast future six click cligj click-plugins munch fiona python-dateutil pytz pyproj shapely pip install git+https://github.com/msgpack/msgpack-python pip install git+https://github.com/davisking/dlib pip install git+https://github.com/ageitgey/face_recognition pip install git+https://github.com/jrosebr1/imutils pip install --ignore-installed --upgrade pyglet pip install --ignore-installed --upgrade pygame pip install --ignore-installed --upgrade cocos2d pip install --ignore-installed --upgrade geopandas pip install git+https://github.com/DinoTools/python-overpy # conda-forge か pip install git+https://github... でインストールするもの pip install git+https://github.com/python-visualization/folium conda install -y -c conda-forge exifread conda install -y -c conda-forge haversine conda install -y -c conda-forge utm conda install -y -c conda-forge gdal #again conda install -y conda conda update -y --all
※ 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら, y + Enter で続行する.「反応が遅いなあ」と思ったら、Enterキーを押してみる.
https://github.com/spyder-ide/spyder に記載の手順に従う
pyenv shell anaconda3-5.3.0 pip install -U PyQt5 pip install git+https://github.com/spyder-ide/spyder-kernels pip install git+https://github.com/spyder-ide/qtpy cd /tmp git clone https://github.com/spyder-ide/spyder.git cd spyder git pull python bootstrap.py python setup.py install
「spyder」で、試しに起動してみる.
sudo apt -y update sudo apt -y install swig
http://www.swig.org/Doc1.3/Python.html#Python_nn6 に記載のサンプルプログラム
%module example %{ #define SWIG_FILE_WITH_INIT #include "example.h" %} int fact(int n);
#include "example.h" int fact(int n) { if (n < 0){ /* This should probably return an error, but this is simpler */ return 0; } if (n == 0) { return 1; } else { /* testing for overflow would be a good idea here */ return n * fact(n-1); } }
int fact(int n);
#!/usr/bin/env python """ setup.py file for SWIG example """ from distutils.core import setup, Extension example_module = Extension('_example', sources=['example_wrap.c', 'example.c'], ) setup (name = 'example', version = '0.1', author = "SWIG Docs", description = """Simple swig example from docs""", ext_modules = [example_module], py_modules = ["example"], )
端末で次のように操作
pyenv shell anaconda3-5.3.0 swig -python example.i python setup.py build_ext --inplace ls -la example.* build
import example example.fact(4) exit()
参考Webページ https://qiita.com/ruteshi_SI_shiteru/items/be6a58276bdbd67dc096
~/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.0/pkgs/pip-9.0.3-py36_0/lib/python3.6/site-packages/pip/compat/__init__.py をエディタで修正.
※ 「pip-9.0.3-py36_0」のところは違うかも.
修正前
修正後
修正前
修正後
pyenv shell 2.7.15 cd /tmp sudo rm -f get-pip.py curl -O https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py python get-pip.py
※ 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら, y + Enter で続行する.「反応が遅いなあ」と思ったら、Enter キーを押してみる.
端末で,次のコマンドを実行する. pip を利用.sudo は付けない.
pyenv shell 2.7.15 pip install --ignore-installed --upgrade numpy pip install --ignore-installed --upgrade six pip install --ignore-installed --upgrade protobuf pip install --ignore-installed --upgrade pillow pip install --ignore-installed --upgrade hdf5 pip install --ignore-installed --upgrade h5py pip install --ignore-installed --upgrade chainer # pip install --ignore-installed --upgrade scikit-learn pip install --ignore-installed --upgrade scikit-image pip install --ignore-installed --upgrade matplotlib pip install --ignore-installed --upgrade seaborn pip install --ignore-installed --upgrade graphviz pip install --ignore-installed --upgrade pydot pip install --ignore-installed --upgrade yaml pip install --ignore-installed --upgrade flask pip install --ignore-installed --upgrade django pip install --ignore-installed --upgrade sympy pip install --ignore-installed --upgrade pandas pip install --ignore-installed --upgrade sqlite pip install --ignore-installed --upgrade redis pip install --ignore-installed --upgrade scipy pip install --ignore-installed --upgrade gensim pip install --ignore-installed --upgrade opencv pip install --ignore-installed --upgrade pylint pip install --ignore-installed --upgrade bz2file pip install --ignore-installed --upgrade PyOpenGL pip install --ignore-installed --upgrade ipykernel # pip install ... か github を使うもの # 最初の conda ... は、下の pip でいれているものの前提ソフトウェア pip install --ignore-installed --upgrade termcolor astor wheel setuptools six protobuf werkzeug markdown absl-py grpcio gast future six click cligj click-plugins munch fiona python-dateutil pytz pyproj shapely pip install git+https://github.com/msgpack/msgpack-python pip install git+https://github.com/davisking/dlib pip install git+https://github.com/ageitgey/face_recognition pip install git+https://github.com/jrosebr1/imutils pip install --ignore-installed --upgrade pyglet pip install --ignore-installed --upgrade pygame pip install --ignore-installed --upgrade cocos2d pip install --ignore-installed --upgrade geopandas pip install git+https://github.com/DinoTools/python-overpy pip install pyproj rtree shapely fiona gdal geopandas pip install --ignore-installed --upgrade exifread pip install --ignore-installed --upgrade haversine pip install --ignore-installed --upgrade utm # pip install --ignore-installed --upgrade gdal #again pip install --ignore-installed --upgrade conda
※ 「Proceed ([y]/n)?」と表示されたら, y + Enter で続行する.「反応が遅いなあ」と思ったら、Enterキーを押してみる.