Bio-Formats のインストール（Windows 上）

【概要】

Bio-Formats は，ライフサイエンス分野の画像ファイル形式を読み書きするための Java ライブラリである．Open Microscopy Environment（OME）が開発しており，百を超えるファイル形式に対応する．このページでは，Windows 上で Git を用いてソースコードを取得し，Apache Maven でビルドしてインストールする手順を説明する．

ソフトウェアの利用条件等は，利用者で確認すること．

【目次】

前準備
Bio-Formats のインストール

【関連する外部ページ】

Bio-Formats の Web ページ: https://www.openmicroscopy.org/bio-formats/
Bio-Formats のソースコード（GitHub）: https://github.com/ome/bioformats
Git の Web ページ: https://git-scm.com/

【サイト内の関連情報】

Windows での Temurin 25 JDK（Java 25）のインストール: 別ページ »で説明
Windows での Apache Maven のインストール: 別ページ »で説明
Windows での Git のインストール: 別ページ »で説明

前準備

Temurin 25 JDK（Java 25）のインストール

Windows での Temurin 25 JDK（Java 25）のインストール手順は，「別のページ」で説明している．

Bio-Formats 8.5.0 は Java 21 以上のビルドに対応する（Java 8 のサポートは 2026 年 3 月に終了した）．本手順では Temurin 25 JDK（Java 25）を用いる．

Apache Maven のインストール

Windows での Apache Maven のインストール手順は，「別のページ」で説明している．

Git のインストール

Git の URL: https://git-scm.com/

Windows での Git のインストール手順は，「別のページ」で説明している．

Windows では，Git の改行コードの設定を core.autocrlf=input にしておく（Windows 既定の改行コードのままだとビルドに失敗する）．

Bio-Formats のインストール

以下の操作をコマンドプロンプトで実行する（手順：Windowsキーまたはスタートメニュー → cmd と入力 →「コマンドプロンプト」を選択）。

Git の改行コードの設定

git config --global core.autocrlf input

ディレクトリ（フォルダ）の作成
```
mkdir C:\bioformats
```

ダウンロード（ソースコードの取得）

cd C:\bioformats
rmdir /s /q bioformats
git clone https://github.com/ome/bioformats

インストール（ビルド）
Maven を実行する．Bio-Formats は既定で install が実行され，ビルドした JAR ファイルがローカルの Maven リポジトリ（~/.m2/repository）にコピーされる．
```
cd C:\bioformats\bioformats
mvn install
```
インストール終了の確認
エラーメッセージが出ていないこと