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Segment Anything in High Quality のインストールと動作確認（ゼロショットのセグメンテーション）（PyTorch を使用）（Windows 上）

全体構成 人工知能 ３次元，地図 プログラミング 情報工学全般 インストール 支援 連絡先，業績

【要約】

HQ-SAMは、既存のSAM（Segment Anything Model）を拡張し、高精度なゼロショットセグメンテーションを実現する。SAMはプロンプトを用いてオブジェクトのセグメンテーションを行うものである。HQ-SAMはSAMを拡張し、高品質なセグメンテーションを可能にするために新しいアプローチを採用している。この手法はWindows上で実行できる。インストールと使用手順とPythonプログラムは公式ページで提供されている、このページでは，インストールと使用手順の説明に加えて、学習済みモデルを使用してセグメンテーションマスクを生成するPythonプログラムも示している．

【目次】

  1. 前準備
  2. Segment Anything in High Quality のインストール（Windows 上）
  3. ゼロショットのセグメンテーションの実行（HQ-SAM，Python，PyTorch を使用）（Windows 上）

元画像と，生成されたセグメンテーションマスク

HQ-SAM (Segment Anything in High Quality)

HQ-SAMは、既存のSAM（Segment Anything Model）を拡張し、より高精度なゼロショットセグメンテーションを実現する手法である。SAMは、プロンプト（点、バウンディングボックス、粗いマスクなど）を入力として、多様なオブジェクトや視覚構造のセグメンテーションを可能にするモデルである。しかし、SAMは細かい構造を持つオブジェクトに対するセグメンテーションが不十分で、その精度に限界がある。この問題を解決するために、HQ-SAMはSAMを拡張している。HQ-SAMでは、SAMのマスクデコーダに新しい学習可能な「HQ-Output Token」を導入している。さらに、グローバルなセマンティックコンテキストとローカルな境界（バウンダリ）の詳細を両方考慮する「Global-local Feature Fusion」も導入されている。複数のデータセットでの実験により、HQ-SAMが高精度なセグメンテーションマスクを生成できることが確認されている。

【文献】 Ke, Lei and Ye, Mingqiao and Danelljan, Martin and Liu, Yifan and Tai, Yu-Wing and Tang, Chi-Keung and Yu, Fisher, Segment Anything in High Quality, arXiv:2306.01567, 2023.

https://arxiv.org/pdf/2306.01567v1.pdf

【関連する外部ページ】

【関連項目】 SAM (Segment Anything Model)

前準備

Git のインストール（Windows 上）

Gitは，バージョン管理システム．ソースコードの管理や複数人での共同に役立つ．

【サイト内の関連ページ】

Windows での Git のインストール: 別ページ »で説明している．

【関連する外部ページ】

Git の公式ページ: https://git-scm.com/

Python のインストール（Windows 上）

【サイト内の関連ページ】

【関連する外部ページ】

Python の公式ページ: https://www.python.org/

Build Tools for Visual Studio 2022，NVIDIA ドライバ，NVIDIA CUDA ツールキット 11.8，NVIDIA cuDNN 8.6 のインストール（Windows 上）

【サイト内の関連ページ】

NVIDIA グラフィックスボードを搭載しているパソコンの場合には， NVIDIA ドライバ， NVIDIA CUDA ツールキット， NVIDIA cuDNN のインストールを行う．

【関連する外部ページ】

PyTorch のインストール（Windows 上）

  1. Windows で，コマンドプロンプトを管理者として実行

    コマンドプロンプトを管理者として実行: 別ページ »で説明

  2. PyTorch のページを確認

    PyTorch のページ: https://pytorch.org/index.html

  3. 次のようなコマンドを実行（実行するコマンドは，PyTorch のページの表示されるコマンドを使う）．

    次のコマンドは， PyTorch 2.0 （NVIDIA CUDA 11.8 用） をインストールする． 但し，Anaconda3を使いたい場合には別手順になる．

    事前に NVIDIA CUDA のバージョンを確認しておくこと（ここでは，NVIDIA CUDA ツールキット 11.8 が前もってインストール済みであるとする）．

    PyTorch で，GPU が動作している場合には，「torch.cuda.is_available()」により，True が表示される． 

    python -m pip install -U --ignore-installed pip
python -m pip install -U torch torchvision torchaudio numpy --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu118
python -c "import torch; print(torch.__version__, torch.cuda.is_available())"

    [image]

    Anaconda3を使いたい場合には， Anaconda プロンプト (Anaconda Prompt) を管理者として実行し， 次のコマンドを実行する． （PyTorch と NVIDIA CUDA との連携がうまくいかない可能性があるため，Anaconda3を使わないことも検討して欲しい）． 

    conda install -y pytorch torchvision torchaudio pytorch-cuda=11.8 cudnn -c pytorch -c nvidia
py -c "import torch; print(torch.__version__, torch.cuda.is_available())"

    【サイト内の関連ページ】

    【関連する外部ページ】

Segment Anything in High Quality のインストール（Windows 上）

公式の GitHub ページ: https://github.com/SysCV/sam-hq の記載に従う．

  1. Windows で，コマンドプロンプトを管理者として実行

    コマンドプロンプトを管理者として実行: 別ページ »で説明

  2. ダウンロードとインストール 

    cd %HOMEPATH%
rmdir /s /q sam-hq
git clone --recursive https://github.com/syscv/sam-hq
cd sam-hq
python -m pip install -e .
python -m pip install -U opencv-python pycocotools matplotlib onnxruntime onnx gdown
mkdir pretrained_checkpoint
  3. 終了の確認

    エラーメッセージが出ていないこと．

    [image]
  4. 学習済みモデルのダウンロード

    学習済みモデルは，公式ページ https://github.com/SysCV/sam-hq で公開されている．

    [image]

    次のコマンドを実行することにより， 公式ページで公開されている学習済みモデル vit_b: ViT-B HQ-SAM model, vit_l: ViT-L HQ-SAM model, vit_h: ViT-H HQ-SAM model, vit_tiny (Light HQ-SAM for real-time need): ViT-Tiny HQ-SAM model をダウンロードする． 

    cd %HOMEPATH%\sam-hq
cd pretrained_checkpoint
curl -L -O https://huggingface.co/lkeab/hq-sam/resolve/main/sam_hq_vit_b.pth
curl -L -O https://huggingface.co/lkeab/hq-sam/resolve/main/sam_hq_vit_l.pth
curl -L -O https://huggingface.co/lkeab/hq-sam/resolve/main/sam_hq_vit_h.pth
curl -L -O https://huggingface.co/lkeab/hq-sam/resolve/main/sam_hq_vit_tiny.pth

    [image]
  5. 動作確認のためデモを実行． 

    cd %HOMEPATH%\sam-hq
python -m pip install -U timm
python demo\demo_hqsam.py
  6. 実行の結果，エラーメッセージが出ないことを確認

    [image]

    元画像の画像ファイルは，demo\input_imgs にある

    [image]

    結果の画像ファイルは，demo\hq_sam_result にある

    [image]

ゼロショットのセグメンテーションの実行（HQ-SAM，Python，PyTorch を使用）（Windows 上）

画像全体からセグメンテーション・マスクを生成（HQ-SAMを使用）（Windows 上）

実行時にファイルを選択する．ファイルは複数選択可能である．

  1. Windows で，コマンドプロンプトを実行
  2. エディタを起動 
    cd %HOMEPATH%\sam-hq
notepad segment.py
  3. エディタで，次のプログラムを保存

    このプログラムは，公式の Sement Anything のページで公開されていたものを参考に作成． 

    from segment_anything import SamAutomaticMaskGenerator, sam_model_registry

sam_checkpoint = "./pretrained_checkpoint/sam_hq_vit_h.pth"
model_type = "vit_h" #"vit_l/vit_b/vit_h/vit_tiny"
device = "cuda"

sam = sam_model_registry[model_type](checkpoint=sam_checkpoint)
sam.to(device=device)
mask_generator = SamAutomaticMaskGenerator(sam)


import numpy as np
import torch
import matplotlib.pyplot as plt
import cv2
import tkinter as tk
from tkinter import filedialog

root = tk.Tk()
root.withdraw()
fpaths = filedialog.askopenfilenames()

def show_anns(anns):
    if len(anns) == 0:
        return
    sorted_anns = sorted(anns, key=(lambda x: x['area']), reverse=True)
    ax = plt.gca()
    ax.set_autoscale_on(False)

    img = np.ones((sorted_anns[0]['segmentation'].shape[0], sorted_anns[0]['segmentation'].shape[1], 4))
    img[:,:,3] = 0
    for ann in sorted_anns:
        m = ann['segmentation']
        color_mask = np.concatenate([np.random.random(3), [0.35]])
        img[m] = color_mask
    ax.imshow(img)


i = 0
for fpath in root.tk.splitlist(fpaths):
    print("file name: ", fpath)
    bgr = cv2.imread(fpath)
    rgb = cv2.cvtColor(bgr, cv2.COLOR_BGR2RGB)
    plt.figure(figsize=(20,20))
    plt.imshow(rgb)
    plt.axis('off')  
    plt.show()

    masks = mask_generator.generate(rgb)
    plt.figure(figsize=(20,20))
    plt.imshow(rgb)
    show_anns(masks)
    plt.axis('off')  
    plt.savefig(str(i)+".png", bbox_inches='tight', pad_inches=0, transparent=True)
    print(str(i)+".png"+" saved.")
    plt.show()
    plt.close()  # グラフを閉じる
    i = i + 1

    [image]
  4. Python プログラムの実行

    Python プログラムの実行

    Python 開発環境（Jupyter Qt Console, Jupyter ノートブック (Jupyter Notebook), Jupyter Lab, Nteract, Spyder, PyCharm, PyScripterなど）も便利である．

    Python のまとめ: 別ページ »にまとめ

    プログラムを segment.pyのようなファイル名で保存したので， 「python segment.py」のようなコマンドで行う． 

    python segment.py

    [image]
  5. ファイル選択画面が出るので，画像ファイルを選択する．画像ファイルは複数選択可能である．

    [image]
  6. 元画像が表示される．

    確認したら，右上の「x」をクリックする．右上の「x」をクリックするまでは，プログラム実行は中断している．

    [image]
  7. しばらく待つと，セグメンテーション・マスクが表示される．

    確認したら，右上の「x」をクリックする．右上の「x」をクリックするまでは，プログラム実行は中断している．

    [image]
  8. セグメンテーション・マスクは，画像ファイルにも保存される．

    ファイル名は，0.png, 1.png, 2.png, ... のようになっている．

パソコンのビデオカメラ

パソコンのビデオカメラで実行する．

  1. Windows で，コマンドプロンプトを実行
  2. エディタを起動 
    cd %HOMEPATH%\sam-hq
notepad vidcam.py

    [image]
  3. エディタで，次のプログラムを保存

    このプログラムは，公式の Sement Anything のページで公開されていたものを参考に作成．

    最も軽量である vit_tiny (Light HQ-SAM for real-time need): ViT-Tiny HQ-SAM model を使用． 

    from segment_anything import SamAutomaticMaskGenerator, sam_model_registry
import numpy as np
import torch
import matplotlib.pyplot as plt
import cv2

def main():
    sam_checkpoint = "./pretrained_checkpoint/sam_hq_vit_tiny.pth"
    model_type = "vit_tiny" #"vit_l/vit_b/vit_h/vit_tiny"
    device = "cuda"

    sam = sam_model_registry[model_type](checkpoint=sam_checkpoint)
    sam.to(device=device)
    mask_generator = SamAutomaticMaskGenerator(sam)

    def get_anns(anns):
        if len(anns) == 0:
            return
        sorted_anns = sorted(anns, key=(lambda x: x['area']), reverse=True)
        ax = plt.gca()
        ax.set_autoscale_on(False)

        img = np.ones((sorted_anns[0]['segmentation'].shape[0], sorted_anns[0]['segmentation'].shape[1], 4))
        img[:, :, 3] = 0
        for ann in sorted_anns:
            m = ann['segmentation']
            color_mask = np.concatenate([np.random.random(3), [0.35]])
            img[m] = color_mask
        return img

    print("Prease press q to exit")
    cap = cv2.VideoCapture(0)
    while (cap.isOpened()):
        r, f = cap.read()
        if (r == False):
            print("Video Capture Error")
            break
        else:
            cv2.imshow('Video Capture', f)
            if cv2.waitKey(1) & 0xFF == ord('q'):
                break
            masks = mask_generator.generate(f)
            img = get_anns(masks)
            cv2.imshow('SAM Result', img)
            if cv2.waitKey(1) & 0xFF == ord('q'):
                break

    cap.release()
    cv2.destroyAllWindows()

if __name__ == "__main__":
    main()

    [image]
  4. Python プログラムの実行

    Python プログラムの実行

    Python 開発環境（Jupyter Qt Console, Jupyter ノートブック (Jupyter Notebook), Jupyter Lab, Nteract, Spyder, PyCharm, PyScripterなど）も便利である．

    Python のまとめ: 別ページ »にまとめ

    プログラムを vidcam.pyのようなファイル名で保存したので， 「python vidcam.py」のようなコマンドで行う． 

    python vidcam.py

    [image]
  5. ビデオカメラの画像の画面と処理結果の画像の画面が出るので確認

    q キーで終了する．

    [image]

    [image]

プロンプトを指定してからセグメンテーション・マスクを生成（HQ-SAMを使用）（Windows 上）

使い方：「masks, scores, logits = predictor.predict()」の引数にプロンプトを設定．実行したらファイルを選択．画像を確認したら，画像をクリックした後，キーボードのキーをクリックして次に進む 

import cv2
import numpy as np
from segment_anything import SamPredictor, sam_model_registry

sam_checkpoint = "./pretrained_checkpoint/sam_hq_vit_h.pth"
model_type = "vit_h"
device = "cuda"

sam = sam_model_registry[model_type](checkpoint=sam_checkpoint)
sam.to(device=device)
predictor = SamPredictor(sam)

import tkinter as tk
from tkinter import filedialog

root = tk.Tk()
root.withdraw()
fpaths = filedialog.askopenfilenames()

for fpath in root.tk.splitlist(fpaths):
    print("file name: ", fpath)
    bgr = cv2.imread(fpath)
    rgb = cv2.cvtColor(bgr, cv2.COLOR_BGR2RGB)
    cv2.imshow("1", rgb)
    print("press a key to continue")
    cv2.waitKey(0)

    predictor.set_image(rgb)
    masks, scores, logits = predictor.predict(
        point_coords=None,
        point_labels=None,
        box = None,
        multimask_output=False,
        hq_token_only= False,
    )
    opencv_mat = cv2.cvtColor(masks[0].astype(np.uint8) * 255, cv2.COLOR_GRAY2BGR)
    cv2.imshow("2", opencv_mat)
    print("press a key to continue")
    cv2.waitKey(0)
    cv2.destroyAllWindows()

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