Ubuntu, Fedora で Octave バージョン 3.8.0 のビルドとインストールとテスト実行

Octave とは，MATLAB に互換の数値解析ソフトウェア．

◆ このページでは，Octave のソースコードをダウンロードし， Ubuntu や Fedora 上でビルドしてインストールする手順を図解などで説明する．

◆ なぜ，ソースコードからビルドするのか？

Octave に ATLAS を組み込みたい
最新版を追いかけたみたい

などの場合には，この Web ページの手順が参考になるでしょう．

※ Octave をパッケージ (yum) を使ってインストールしたい（わざわざソースコードからビルドしない）場合は，別の Web ページを見てください．

※ liboctave の使い方については，別のページで説明している．liboctave を使って，Octave の行列関係の機能を呼び出すような C++ のプログラムを簡単に作ることができる．

※ 貴重な情報源: http://www40.atwiki.jp/gnuoctavejp （Octave for Windows メモの著者様による Wiki）

※ 関連Webページ: Octave の活用

http://software.intel.com/en-us/articles/using-intel-mkl-in-gnu-octave/

【要点】

Octave に GotoBLAS あるいは ATLAS（いずれも BLAS の実装)を組み込みたい．あるいは Intel Math Kernel Library (インテル・マス・カーネル・ライブラリ) とリンクさせたい．
BLAS とは？
BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)とは，行列演算，ベクトル演算の機能をもったプログラム群です． GotoBLAS や ATLAS は，無料で使えるソフトウェアの中では，BLAS 実装の決定版といってよいでしょう．※ 他にも，優れた実装が複数あります．
＜BLAS の主な機能（ごく一部を紹介）＞
- Level 1 ベクトルとベクトルの演算
  - DOT : 内積
  - AXPY : AXPY 演算 ( y <- ax + y の形など)
  - NORM : ノルム　など
- Level 2 行列とベクトルと計算
  - 行列とベクトルの積 ( y <- Ax )
  - 行列の rank-1 更新 ( A <- A + xy' )
- Level 3 行列同士の演算
  - 行列と行列の積 ( Z <- XY )
LAPACK とは？
LAPACK とは，行列に関する種々の計算（連立１次方程式，固有値問題，などなど多数）のソフトウェア． LAPACK は Octave に必要．
BLAS (GotoBLAS あるいは ATLAS) を組み込むには， Octave をソースコードからビルドするのが簡単です．
※ GotoBLAS は素晴らしいプログラムで，しかも，無料で使える．但し，GotoBLAS はフリーソフトウェアではない．「再配布や，商用・業務利用は原則不可」と明記されている．再配布不可ですから，ソースコードやビルドしたバイナリを人にあげることはできません（パソコンを借りてインストールしてあげる，ということも難しい，という意味です）．
※ GotoBLAS のライセンス条項に「不安」がある場合は，ATLAS を使うことも検討してください．（決して違法なことはしないように）．
※ ATLAS も素晴らしいプログラムで，無料で使える． ATLAS は BSD ライセンスとなっているようです．ライセンスは，各自でよく確認してください．ライセンスからいうと，GotoBLAS より使い勝手が良さそうです．
Octave をソースコードからビルドすると， Intel Math Kernel Library (インテル・マス・カーネル・ライブラリ) とリンクさせることも簡単にできる．

【この Web ページで行うこと】

Linux を使う．
Octaveは，ソースコードを使ってビルドします．
https://www.gnu.org/software/octave/ Octave の本家からソースコードをダウンロード．
ソースコードからビルドするので C, C++, Fortran コンパイラなどが必要．
このページでは，SuiteSparse や Metis をソースコードからビルドする手順も補足的に書いています．

Octave のオンラインマニュアル

Octave オンラインマニュアル: https://www.gnu.org/software/octave/

謝辞

本 Web ページは，Linux での Octave のビルドとインストール法に焦点をあてていますが，本 Web ページの作成にあたっては，まず， 「octave for windowsメモの筆者」様（http://www.tatsuromatsuoka.com/octave/jpn/OctaveWinMemo.html （当時の URL，現存しない））に， 2ちゃんねる (http://2ch.net/) の「データ解析ツールoctaveを語ろう」掲示板での議論を通して，数々の貴重なご教示，コメント頂きました．ありがとうございました．

Metis の取り扱いについて
Metis は再配布不可．ビルドしたバイナリであっても再配布不可
GotoBLAS の取り扱いについて
GotoBLAS は再配布不可．ビルドしたバイナリであっても再配布不可
「SuiteSparse のビルドでは，BLAS (GotoBLAS など) があった方がよいかも」というご示唆
あった方が SuiteSparse の実行形式プログラムのビルドなどもできて便利．

などなど．

敬意を込めて，「octave for windowsメモの筆者」様の URL を記しておきます． http://www.tatsuromatsuoka.com/octave/jpn/OctaveWinMemo.html （当時の URL，現存しない）

⇒ この Web ページは，分かりやすく，また，Octave に関係する種々の有益な情報が載ったページです．情報の宝庫，オンリーワンの Web ページと言ってよいでしょう．

Ubuntu で Octave のソースコードのインストール（ソースコードを使用）を行うシェルスクリプト

楽をしたいのでシェルスクリプトを作りました。１つ１つコマンドを入力したい（シェルスクリプトにしたくない）場合については、この Web ページの下で説明している． Octave バージョン 3.8.0 のインストール（ソースコードを使用）が行われます．前提ソフトウェアとして用いる graphicsmagick, curl, gsl, fftw3, glpk, qrupdate, suitesparce, lapack, atlas のインストールも行う． Ubuntu 12.04 を用いて動作確認済みです．

■ 前準備

Intel のコンパイラやIntel Math Kernel Library を使う場合には、.bashrc などで「export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/ia32:/opt/intel/lib/ia32」あるいは「export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64:/opt/intel/lib/intel64」のように設定しておくこと。

■ シェルスクリプト

#!/bin/bash
 
sudo apt -y install build-essential

# GNU gcc, g++, gfortran を使う場合: gcc, g++, gfortran
# Intel Compiler を使う場合: CC=icc, icpc, ifort 
if [ -x /opt/intel/bin/icc ]; then 
  if [ -x /opt/intel/bin/ifort ]; then 
    echo USE Intel Compiler 
    export USEINTEL=YES
  fi
fi
if [ -x /opt/intel/bin/compilervars.sh ]; then 
    echo USE Intel MKL 
    export USEMKL=YES
fi

if [ "$USEMKL" = "YES" ]; then
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
    source /opt/intel/bin/compilervars.sh ia32
  fi
  if [ `arch` = 'x86_64' ]; then
    source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64
  fi
fi

# octave 前提ソフトウェア (Octave build dependency softwares)
cd /tmp; sudo apt-get source octave3.2
cd /tmp; sudo apt-get build-dep octave3.2

# /etc/ld.so.conf
sudo cp /etc/ld.so.conf /etc/ld.so.conf.$$
echo "/usr/local/lib" | sudo tee -a >> /etc/ld.so.conf
echo "/usr/local/lib/octave/3.8.0" | sudo tee -a >> /etc/ld.so.conf
sudo /sbin/ldconfig

# graphicsmagick 
  sudo apt -y install graphicsmagick-dbg
  sudo apt -y install graphicsmagick
  sudo apt -y install graphicsmagick-imagemagick-compat
  sudo apt -y install graphicsmagick-libmagick-dev-compat
  sudo apt -y install libgraphics-magick-perl
  sudo apt -y install libgraphicsmagick++1-dev
  sudo apt -y install libgraphicsmagick++3
  sudo apt -y install libgraphicsmagick1-dev
  sudo apt -y install libgraphicsmagick3

# curl
  sudo apt -y install curl
  sudo apt -y install libcurl3-dbg
  sudo apt -y install libcurl3-gnutls
  sudo apt -y install libcurl3
  sudo apt -y install libcurl4-gnutls-dev

# gsl
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/gsl
  cd  /tmp/gsl
  apt-get source gsl
  sudo apt-get -yV build-dep gsl
  cd gsl-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install gsl-bin
  sudo apt -y install libgsl0-dbg
  sudo apt -y install libgsl0-dev
  sudo apt -y install libgsl0ldbl
fi

# fftw3
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/fftw3
  cd  /tmp/fftw3
  apt-get source fftw3
  sudo apt-get -yV build-dep fftw3
  cd fftw3-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install libfftw3-3
  sudo apt -y install libfftw3-dev
  sudo apt -y install libfftw3-doc
fi

# glpk
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/glpk
  cd  /tmp/glpk
  apt-get source glpk
  sudo apt -y install libiodbc2-dev 
  sudo apt-get -yV build-dep glpk
  cd glpk-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install glpk-doc
  sudo apt -y install glpk-utils
  sudo apt -y install libglpk-dev
  sudo apt -y install libglpk0-dbg
  sudo apt -y install libglpk0
  sudo apt -y install glpk
fi

# qrupdte 
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/qrupdate
  cd  /tmp/qrupdate
  apt-get source qrupdate
  sudo apt-get -yV build-dep qrupdate
  cd qrupdate-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install libqrupdate-dev
  sudo apt -y install libqrupdate1
fi

# arpack
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/arpack
  cd /tmp/arpack
  apt-get source arpack
  sudo apt-get -yV build-dep arpack
  cd arpack-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install libarpack2-dbg
  sudo apt -y install libarpack2-dev
  sudo apt -y install libarpack2
fi

# suitesparse-metis 
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  mkdir /tmp/suitesparse-metis
  cd  /tmp/suitesparse-metis
  apt-get source suitesparse-metis
  sudo apt-get -yV build-dep suitesparse-metis
  cd suitesparse-metis-*
  CC=icc CXX=icpc F77=ifort dpkg-buildpackage -rfakeroot
  cd ..
  sudo dpkg -i *.deb
else
# package install
  sudo apt -y install libsuitesparse-metis-3.1.0
  sudo apt -y install libsuitesparse-metis-dbg
  sudo apt -y install libsuitesparse-metis-dev
fi

# LAPACK をパッケージを用いてインストール (install the LAPACK softwares using package)
sudo apt -y install liblapack-dev
sudo apt -y install liblapack-test
sudo apt -y install liblapack-doc
sudo apt -y install liblapack3gf
sudo apt -y install liblapack-pic

# BLAS 参照実装のダウンロードとビルド (Download BLAS reference implementarion and build it and install it) 
cd /tmp
if [ ! -f blas.tgz ]; then 
    wget http://netlib.org/blas/blas.tgz 
fi 
rm -rf BLAS
tar -xvzof blas.tgz
cd /tmp/BLAS
if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
    make LOADER="ifort -fPIC" FORTRAN="ifort -m32 -fPIC" 
  elif [ `arch` = 'x86_64' ]; then
    make LOADER="ifort -fPIC" FORTRAN="ifort -m64 -fPIC" 
  fi
else
# GNU Compiler
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
    make LOADER="gfortran -fPIC" FORTRAN="gfortran -m32 -fPIC" 
  elif [ `arch` = 'x86_64' ]; then
    make LOADER="gfortran -fPIC" FORTRAN="gfortran -m64 -fPIC" 
  fi
fi
cp /tmp/BLAS/blas_LINUX.a /usr/local/lib/libblas_LINUX.a

# Octave のインストール（ソースコードを使用）
cd /tmp
if [ ! -f octave-3.8.0.tar.gz ]; then 
    wget ftp://ftp.gnu.org/gnu/octave/octave-3.8.0.tar.gz
fi

sudo rm -rf octave-3.8.0
tar -xvzof octave-3.8.0.tar.gz
cd octave-3.8.0


if [ "$USEINTEL" = "YES" ]; then
# Intel Compiler (インテル C++ Composer XE Linux 版, インテル Fortran Composer XE Linux 版を使う場合) 
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
    echo "source /opt/intel/bin/compilervars.sh ia32" >> ~/.bashrc
  elif [ `arch` = 'x86_64' ]; then
    echo "source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64" >> ~/.bashrc
  fi
#
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
  # Ubuntu 32 bit version (かきかけ. このままでは動かない)
    export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/ia32:/opt/intel/lib/ia32
      export B1="-lmkl_gf -lmkl_intel -lmkl_intel_thread -lmkl_core -limf -lintlc -liomp5 -lpthread -lquadmath -lm"
      CC=icc CXX=icpc F77=gfortran F1="-fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -march=native -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/ia32 -I/opt/intel/include/ia32 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" LDFLAGS="-L/opt/intel/lib/ia32 -L/opt/intel/mkl/lib/ia32" LIBS="-lmetis -lquadmath" CFLAGS="-ipo- -std=c99 $F1" CPPFLAGS="$F1" FFLAGS="$F1" ./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl --with-blas="${B1}" --with-lapack="${B1}" --with-fftw3="${B1}" --with-fftw3f="${B1}" PTHREAD_LIBS="-lpthread"
  elif [ `arch` = 'x86_64' ]; then
  # Ubuntu 64 bit version (かきかけ. このままでは動かない)
    export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64:/opt/intel/lib/intel64
      export B1="-lmkl_gf_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread  -lmkl_core -limf -lintlc -liomp5 -lpthread -lquadmath -lm" 
      CC=icc CXX=icpc F77=gfortran F1="-m64 -DMKL_LP64 -fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/intel64 -I/opt/intel/include/intel64 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" LDFLAGS="-L/opt/intel/lib/intel64 -L/opt/intel/mkl/lib/intel64" LIBS="-lmetis -lquadmath" CFLAGS="-ipo- -std=c99 $F1" CPPFLAGS="$F1" FFLAGS="$F1" ./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl --with-blas="${B1}" --with-lapack="${B1}" --with-fftw3="${B1}" --with-fftw3f="${B1}" PTHREAD_LIBS="-lpthread"
  fi
else
# GNU Compiler (GNU のコンパイラを使う場合) 
  if [ `arch` = 'i686' ]; then
    # 32 ビット Ubuntu
    if [-d /opt/intel/mkl/lib/ia32 ]; then  
      # try to use Intel MKL 32bit  (GNU のコンパイラ + インテル マス・カーネル・ライブラリー Linux 版) 
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/ia32:/opt/intel/lib/ia32
CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran \
CXXFLAGS="-m32 -fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -march=native -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/ia32 -I/opt/intel/include/ia32 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" 
FFLAGS="-m32 -fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -march=native -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/ia32 -I/opt/intel/include/ia32 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" \
export B1="-L/opt/intel/lib/ia32 -L/opt/intel/mkl/lib/ia32 -lmkl_gf -lmkl_intel -lmkl_intel_thread  -lmkl_core -limf -lintlc -liomp5 -lmetis -lpthread -lquadmath -lm" 
./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="${B1}" \
--with-lapack="${B1}" \
--with-fftw3="${B1}" \
--with-fftw3f="${B1}" \
PTHREAD_LIBS="-lpthread"
    fi
  elif [ `arch` = 'x86_64' && ]; then
    # 64 ビット Ubuntu
    if [ -d /opt/intel/mkl/lib/intel64 ]; then  
      # try to use Intel MKL 64bit  (GNU のコンパイラ + インテル マス・カーネル・ライブラリー Linux 版) 
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64:/opt/intel/lib/intel64
CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran \
CXXFLAGS="-m64 -DMKL_LP64 -fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -march=native -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/intel64 -I/opt/intel/include/intel64 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" \
FFLAGS="-m64 -DMKL_LP64 -fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -march=native -I/usr/include -I/opt/intel/mkl/include/intel64 -I/opt/intel/include/intel64 -I/opt/intel/mkl/include/fftw -I/usr/local/include" \
export B1="-L/opt/intel/lib/intel64 -L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_gf_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread  -lmkl_core -limf -lintlc -liomp5 -lmetis -lpthread -lquadmath -lm" 
./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="${B1}" \
--with-lapack="${B1}" \
--with-fftw3="${B1}" \
--with-fftw3f="${B1}" \
PTHREAD_LIBS="-lpthread"
    fi
  elif [ -d /usr/lib/openblas-base ]; then
    # openBLAS
CXXFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
FFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
./configure --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="-L/usr/lib/openblas-base -lcblas -lopenblas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" \
--with-lapack="-L/usr/lib/lapack -llapack -L/usr/lib/openblas-base -lopenblas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" 
  elif [ -f /usr/lib/atlas-base/libptf77blas.a ]; then
    # Ubuntu package LAPACK and ATLAS (GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK) 
CXXFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
FFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
./configure --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="-L/usr/lib/atlas-base -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" \
--with-lapack="-L/usr/lib/atlas-base -llapack_atlas -llapack -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" 
  else
    # 「-llapack -lblas 」でコンパイル
    F1="-fPIC -DPIC -fomit-frame-pointer -O2 -I/usr/local/include" LDFLAGS="-L/usr/local/lib" LIBS="-lmetis -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl -lquadmath" CFLAGS="$F1" CPPFLAGS="$F1" FFLAGS="$F1" ./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl --with-blas="-lblas -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl -lquadmath" --with-lapack="-llapack -lblas -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl -lquadmath" PTHREAD_LIBS="-lpthread"
  fi
fi

# memo
# LIBS="-lmetis" CFLAGS="-I/usr/local/include -I/usr/local/atlas/include -mieee-fp -DH5_USE_16_API -fomit-frame-pointer -mfpmath=sse -msse3 -fno-schedule-insns2 -fopenmp -fno-tree-loop-optimize -fno-tree-vectorize -fexceptions -march=native -O3 -fopenmp" CPPFLAGS="-I/usr/local/include -I/usr/local/atlas/include -mieee-fp -DH5_USE_16_API -fomit-frame-pointer -mfpmath=sse -msse3 -fno-schedule-insns2 -fopenmp -fno-tree-loop-optimize -fno-tree-vectorize -fexceptions -march=native -O3 -fopenmp" FFLAGS="-DH5_USE_16_API -fomit-frame-pointer -mfpmath=sse -msse3 -fno-schedule-insns2 -fopenmp -fno-tree-loop-optimize -fno-tree-vectorize -fexceptions -march=native -O3 -fopenmp" ./configure --enable-static --enable-shared --enable-dl --with-blas="-L/usr/local/atlas/lib -lptf77blas /usr/local/atlas/lib/libatlas.a -lgfortran -lpthread -lgomp" --with-lapack="-llapack_LINUX -ltmglib_LINUX -L/usr/local/atlas/lib -lptf77blas /usr/local/atlas/lib/libatlas.a -lgfortran -lpthread -lgomp"  

make -j4
make check
sudo make install

Ubuntu で, コマンドを手入力して，Octave のソースコードのインストール（ソースコードを使用）を行う

前もって決めておく事項

作業用ディレクトリ: /tmp (このページでは /tmp と書く)

1. 前提となるソフトウェアのインストール

◆ Ubuntu バージョン 12.04 の場合の操作手順例

Ubuntu の他のバージョンでも同様の手順になります

アップデート操作

sudo apt-get -yV update
sudo apt-get -yV upgrade
sudo reboot

Octaveのビルドで用いる前提ソフトウェアのインストール

# 前提ソフトウェア
cd /tmp; sudo apt-get source octave3.2
cd /tmp; sudo apt-get build-dep octave3.2
# 開発環境等
sudo apt -y install make
sudo apt -y install patch
sudo apt -y install build-essential
sudo apt -y install autoconf
sudo apt -y install automake
sudo apt -y install autogen
sudo apt -y install flex
sudo apt -y install bison
sudo apt -y install gawk
sudo apt -y install libtool
sudo apt -y install ccache
sudo apt -y install binutils
sudo apt -y install openssl
sudo apt -y install libgmp3-devel
sudo apt -y install libmpfr-dev
sudo apt -y install libppl-dev
sudo apt -y install libmpc-dev
sudo apt -y install cpp
sudo apt -y install gcc
sudo apt -y install g++
sudo apt -y install gfortran
sudo apt -y install libreadline-dev
sudo apt -y install gperf
sudo apt -y install libftgl-dev
sudo apt -y install libgomp1
# gsl
sudo apt -y install gsl-bin
sudo apt -y install libgsl0-dev
sudo apt -y install libgsl0-dbg
sudo apt -y install libgsl0ldbl
# atlas
sudo apt -y install libatlas-base-dev
sudo apt -y install libatlas-dev
sudo apt -y install libatlas-doc
sudo apt -y install libatlas-test
sudo apt -y install libatlas3gf-base
# lapack
sudo apt -y install liblapack-dev
sudo apt -y install liblapack-doc
sudo apt -y install liblapack-pic
sudo apt -y install liblapack-test
sudo apt -y install liblapack3gf
# pcre
sudo apt -y install libpcre3-dev
# readline
sudo apt -y install libreadline-dev
# arpack
sudo apt -y install libarpack2-dbg
sudo apt -y install libarpack2-dev
sudo apt -y install libarpack2
# cURL
sudo apt -y install curl
sudo apt -y install libcurl3-dbg
sudo apt -y install libcurl3-gnutls
sudo apt -y install libcurl3
sudo apt -y install libcurl4-gnutls-dev
# fftw3
sudo apt -y install libfftw3-3
sudo apt -y install libfftw3-dev
sudo apt -y install libfftw3-doc
# FLTK  
sudo apt -y install libfltk1.3-dev
# fontconfig
sudo apt -y install fontconfig
sudo apt -y install libfontconfig1-dev
# freetype
sudo apt -y install libfreetype6-dev
# glpk
sudo apt -y install glpk
sudo apt -y install libglpk-dev
# gl2ps
sudo apt -y install libgl2ps-dev
# gnuplot
sudo apt -y install gnuplot
# graphicsmagick
sudo apt -y install graphicsmagick-dbg
sudo apt -y install graphicsmagick
sudo apt -y install libgraphics-magick-perl
sudo apt -y install libgraphicsmagick++1-dev
sudo apt -y install libgraphicsmagick++3
sudo apt -y install libgraphicsmagick1-dev
sudo apt -y install libgraphicsmagick3
# Qhull
sudo apt -y install libqhull-dev
# qrupdate
sudo apt -y install libqrupdate-dev
sudo apt -y install libqrupdate1
# qscintilla
sudo apt -y install libqscintilla2-dev 
# qt
sudo apt -y install libqt4-dev 
# SuiteSparse
sudo apt -y install libamd2
sudo apt -y install libbtf1
sudo apt -y install libcamd2
sudo apt -y install libccolamd2
sudo apt -y install libcholmod1
sudo apt -y install libcolamd2
sudo apt -y install libcsparse2
sudo apt -y install libcxsparse2
sudo apt -y install libklu1
sudo apt -y install libldl2
sudo apt -y install libsuitesparse-dbg
sudo apt -y install libsuitesparse-dev
sudo apt -y install libsuitesparse-doc
sudo apt -y install libumfpack5
sudo apt -y install libsuitesparse-metis
sudo apt -y install libsuitesparse-metis-dev
# zlib
sudo apt -y install zlib1g-dev

◆ Fedora の場合の実行例

パッケージの更新
インストール前に「yum check-update; sudo yum update」を実行しておくとトラブルが減るでしょう．これは更新可能な全パッケージを更新するという操作です．
yum check-update sudo yum update

必須ソフトウェアのインストール

Octave のビルドとインストールに必要になる次のソフトウェアをインストール済みであること．

※ 下記のように「yum install ＜パッケージ名＞」で簡単にインストールできる．

sudo yum -y install bison
sudo yum -y install flex
sudo yum -y install less
sudo yum -y install tetex
sudo yum -y install gcc
sudo yum -y install gcc-c++
sudo yum -y install gcc-gfortran
sudo yum -y install lapack-devel
sudo yum -y install blas-devel
sudo yum -y install atlas-devel
sudo yum -y install ncurses-devel
sudo yum -y install zlib-devel
sudo yum -y install hdf5-devel
sudo yum -y install texinfo
sudo yum -y install qhull-devel
sudo yum -y install readline-devel
sudo yum -y install glibc-devel
sudo yum -y install fftw-devel
sudo yum -y install gsl-devel
sudo yum -y install gperf
sudo yum -y install ghostscript
sudo yum -y install curl-devel
sudo yum -y install pcre-devel
sudo yum -y install texinfo-tex
sudo yum -y install arpack-devel
sudo yum -y install libX11-devel
sudo yum -y install suitesparse-devel
sudo yum -y install glpk-devel
sudo yum -y install gnuplot
sudo yum -y install desktop-file-utils
sudo yum -y install GraphicsMagick-c++-devel
sudo yum -y install fltk-devel
sudo yum -y install ftgl-devel
sudo yum -y install qrupdate-devel
sudo yum -y install rpmlib
sudo yum -y install gsl-devel
sudo yum -y install ffmpeg
sudo yum -y install ffmpeg-devel

metis のインストール

cd /tmp
wget http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome/fetch/sw/metis/metis-5.1.0.tar.gz
tar -xvzof metis-5.1.0.tar.gz
cd metis-5.1.0
make config
make
sudo make install

2. （オプション）ATLAS をソースパッケージを用いてインストール

Ubuntu では、ATLAS のインストールはパッケージを用いて簡単に行うことができる。もし、ATLASのパッケージを用いて何かの問題が出たときは、次の手順で、ATLASのソースパッケージを試すことができる．

インストールに数時間以上かかります．

ATLASのパッケージを用いて問題がなかったときは、この手順を試す必要はありません。

sudo cpufreq-selector -g performance
mkdir /tmp/atlas
cd /tmp/atlas
apt-get source libatlas-dev
sudo apt-get -yV build-dep libatlas-dev
cd atlas-3.8.4
LANG=C sudo dpkg-buildpackage -uc -us -rfakeroot 
cd ..
sudo dpkg -i *.deb

※ /usr/bin/cpufreq-selector が無いときは「sudo apt -y install gnome-applets」

※ 「sudo dpkg -i *.deb」でエラーが出るときは、BIOS メニューで、CPU の電源管理に関する機能を OFF にすると改善する場合がある

3. （オプション）前提ソフトウェアをソースコードからビルドしてインストール

あとで Octave のビルド時に configure を実行しますが，configure でエラーが出る場合，あるいは、octave のテスト時にエラーが出る場合など、ソースコードからビルドし，インストールすることでエラーが回避できる可能性がある．

※ かなり手間と時間がかかりますので、エラーが出たときのみに試すのがいいと考えます．

＜それぞれのインストール手順の Web ページへのリンク＞

GSL のインストール
FFTW のインストール
GLPK のインストール
curl のインストール
LAPACK のインストール
ATLAS のインストール
qrupdate のインストール
arpack のインストール
Metis と SuiteSparse のインストール

4. Octave のソースコードのダウンロード

ここで行うことは， Octave ソースコードをダウンロードすること．

https://www.gnu.org/software/octave/ を開く
「Download」をクリック
「ftp://ftp.gnu.org/gnu/octave」をクリック
「octave-3.8.0.tar.gz」をクリック

ダウンロードが始まる．
ダウンロードしたファイルを /tmp に移す

5. Octave-Forge のソースコードのダウンロード

今度は，https://octave.sourceforge.io/ を開く
「Links」をクリック
「http://sourceforge.net/projects/octave/」をクリック
「Files」をクリック
「Octave Forge」をクリック
最新版をクリック
ファイルをクリック
ダウンロードしたファイル (octave-forge-bundle-20090607.tar.gz ) を /tmp に移す
あとで役に立つことが多いので、ダウンロードしておく．(インストール手順は、この Web ページ中に示します)

6. Octave のビルドとインストールの手順

先ほどダウンロードした octave-3.8.0.tar.gz を解凍
cd /tmp sudo rm -rf octave-3.8.0 tar -xvzof octave-3.8.0.tar.gz
結果の確認（実行結果の例をここに示す）．
/etc/ld.so.conf の調整
設定例は次の通り
■ Octave バージョン 3.8.0 の場合
```
/usr/local/lib
/usr/local/lib/octave/3.8.0
```
◆ Ubuntu 12.04 での設定例
sudo /sbin/ldconfig の実行
sudo /sbin/ldconfig
cd /tmp/octave-3.8.0 の実行
cd /tmp/octave-3.8.0

configure の実行

configure の実行については，いくつかの場合を説明する．

■ 　 Ubuntu の場合 ■

■ Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた OpenBLAS

Octave 3.8.0
OpenBLAS
GNU コンパイラ
Ubuntu 12.04

「sudo apt -y install libopenblas-base libatlas3gf-base」で OpenBLAS のインストールの後，コンソールで次の操作を行う．

◆ configure の操作例


sudo update-alternatives --config libblas.so.3gf
sudo update-alternatives --config liblapack.so.3gf
CXXFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
FFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
./configure --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="-L/usr/lib/openblas-base -lcblas -lopenblas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" \
--with-lapack="-L/usr/lib/lapack -llapack -L/usr/lib/openblas-base -lopenblas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl"

■ Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK

Octave 3.8.0
ATLAS (Ubuntu のパッケージ)
GNU コンパイラ
Ubuntu 12.04

ATLAS をパッケージを用いてインストールの後，コンソールで次の操作を行う．

◆ configure の操作例


sudo update-alternatives --config libblas.so.3gf
sudo update-alternatives --config liblapack.so.3gf
CXXFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
FFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
./configure --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="-L/usr/lib/atlas-base -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" \
--with-lapack="-L/usr/lib/atlas-base -llapack_atlas -llapack -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl"

■ Ubuntu + GNU のコンパイラ + ソースコードからビルドされた ATLAS と LAPACK

Octave 3.8.0
ATLAS 3.10.1 (ソースコードからビルドしてインストール)
GNU コンパイラ
Ubuntu 12.04, 64 ビット版

ATLAS のインストールの後，コンソールで次の操作を行う．

◆ configure の操作例


CXXFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2 -I/usr/local/include -I/usr/local/atlas/include" \
FFLAGS="-fomit-frame-pointer  -fno-schedule-insns2 -fopenmp -mfpmath=sse -msse3  -fexceptions -O2" \
./configure --enable-shared --enable-dl \
--with-blas="-L/usr/local/lib -L/usr/local/atlas/lib -lptcblas -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl" \
--with-lapack="-L/usr/local/lib -L/usr/local/atlas/lib -ltmglib -llapack -lptcblas -lptf77blas -latlas -lmetis -lquadmath -lgfortran -lgomp -lpthread -ldl"

■ 　 Fedora の場合 ■ 　

■ Fedora + GNU のコンパイラ + パッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK

ATLAS (パッケージ)
GNU コンパイラ
Fedora

◆ configure の操作例

CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran LIBS="-lquadmath -lm" CFLAGS="-O3 -fexceptions" CPPFLAGS="-O3 -fexceptions" FFLAGS="-O3 -fexceptions" ./configure --prefix=/usr/local --enable-static --enable-shared --enable-dl --disable-static --with-blas="-L/usr/lib64/atlas -lptf77blas -latlas -lgfortran -lpthread -lquadmath" --with-lapack="-L/usr/lib64/atlas -llapack -lquadmath" --with-qrupdate-libdir=/usr/local/lib PTHREAD_LIBS="-lpthread"

※ なお，metis をリンクしたい場合には「LIBS="-lmetis -lm"」を付ける．

※ OpenMP も使いたい場合は，CFLAGS と CPPFLAGS に「-fopenmp」を付ける

※ Core2 プロセッサであり，かつ，64 ビット Linux を使っている場合.

64 ビット Linux なので「-m64」を付ける．
Core2 プロセッサなので「-mfpmath=sse -msse4.2 -march=native」を付ける．（gcc 等のバージョンによっては，「-mfpmath=sse -mssse3 -march=core2」に変えることもある）
※ -mnative は Pentium 系のマシンにおいて「そのマシンの CPU に特化したコードを生成する」という意味．詳しくは「gcc -E -v -march=native -」

つまり，以下の通り

CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran LIBS="-lquadmath -lm" CFLAGS="-O3 -fexceptions -m64 -march=native -mfpmath=sse -msse4.2" CPPFLAGS="-O3 -fexceptions -m64 -march=native -mfpmath=sse -msse4.2" FFLAGS="-O3 -fexceptions -m64 -march=native -mfpmath=sse -msse4.2" ./configure --prefix=/usr/local --enable-static --enable-shared --enable-dl --disable-static --with-blas="-L/usr/lib64/atlas -lptf77blas -latlas -lgfortran -lpthread -lquadmath" --with-lapack="-L/usr/lib64/atlas -llapack -lquadmath" --with-qrupdate-libdir=/usr/local/lib PTHREAD_LIBS="-lpthread"

■ Fedora + GNU のコンパイラ + ソースコードからビルドされた ATLAS と LAPACK

ATLAS を自前でビルドした場合で，それを使いたい場合は，コンソールで次の操作を行う．

ATLAS を自前でビルドした場合には「-L/usr/lib64/atlas」の部分は「-L/usr/local/atlas/lib」のように変える．例えば，次のようになる．

■ Fedora + GNU のコンパイラ + GotoBLAS

GotoBLAS
GNU コンパイラ
Fedora

GotoBLAS のビルドとインストールの後，コンソールで次の操作を行う．

◆ configure の操作例

CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran LIBS="-lquadmath -lm" CFLAGS="-O3 -fexceptions" CPPFLAGS="-fexceptions" FFLAGS="-O3 -fexceptions" ./configure --prefix=/usr/local --enable-static --enable-shared --enable-dl --disable-static --with-blas="-lgoto -lgfortran -lpthread -lquadmath" --with-lapack="-llapack_LINUX -ltmglib_LINUX -lquadmath" --with-qrupdate-libdir=/usr/local/lib PTHREAD_LIBS="-lpthread"

※ なお，metis をリンクしたい場合には「LIBS="-lmetis -lm"」を付ける．

configure の結果の確認
※ エラーメッセージが出ていないことを確認してください
■ 　 Ubuntu の場合 ■ 　
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた OpenBLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- OpenBLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ configure の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ configure の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + ソースコードからビルドされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS 3.10.1 (ソースコードからビルドしてインストール)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
■ 　 Fedora の場合 ■ 　
Fedora 17 での configure の実行結果例
make の実行
make -j4
make の結果の確認
エラーメッセージが出ていないこと．
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた OpenBLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- OpenBLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ make の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ make の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + ソースコードからビルドされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS 3.10.1 (ソースコードからビルドしてインストール)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
■ 　 Fedora の場合 ■ 　
Fedora 17 での make の実行結果例
(octave バージョン 3.6.2 の場合)
make check の実行
make check
make check の結果の確認
■ 　 Ubuntu の場合 ■
◆ make check の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ make check の実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + ソースコードからビルドされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS 3.10.1 (ソースコードからビルドしてインストール)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
- Octave 3.6.1
- GotoBLAS
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ make check の実行結果例
※ Octave バージョン 3.2.4 の場合， 次のようなエラーが出る場合がある．
```
scripts/image/imread.m ... octave: magick/semaphore.c:525: LockSemaphoreInfo: Assertion `semaphore_info != (SemaphoreInfo *) ((void *)0)' failed.
panic: Aborted -- stopping myself...
```
これは，GraphicsMagick の新しいバージョンに，Octave バージョン 3.2.4 が対応していないことに起因するエラーである． GraphicsMagick の古いバージョンをインストールすることで解決する場合がある．
1. GraphicsMagick-1.2.7.tar.gzのダウンロード→解凍
2. .configure または .configure --without-perl
3. make
4. make install
■ 　 Fedora の場合 ■ 　
Fedora 17 での make check の実行結果例
Octave バージョン 3.6.2 の場合
sudo make install の実行
sudo make install
make install の結果の確認
□ Ubuntu での実行結果例

試しに実行してみる

  X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); tic(); Z = X * Y; toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [L, U, P] = lu(X); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [Z, RCOND] = inv(X); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [D, RCOND] = det(X); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [U, S, V] = svd(X); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [Q, R, P] = qr(X); toc()
  X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); tic(); Z = cov(X, Y); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); [v, L] = eig( cov(X) ); toc()
  X = rand(2000,2000); B = rand(21); tic(); Z = conv2(X, B, 'full'); toc()
  X = rand(2000,2000); tic(); Z = fft2(X, 2000, 2000); toc()
  x = rand(1000000,1); y = rand(1000000,1); tic(); H = convhull(x, y); toc()

Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた OpenBLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- OpenBLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ 実行結果例
Ubuntu + GNU のコンパイラ + Ubuntu のパッケージでインストールされた ATLAS と LAPACK
- Octave 3.8.0
- ATLAS (Ubuntu のパッケージ)
- GNU コンパイラ
- Ubuntu 12.04, 64 ビット版
◆ 実行結果例

Octave-forge のインストール

Octave-forge ソースコードの入手を済ませておくこと
http://sourceforge.net/projects/octave
詳しい手順は，この Web ページの上の方に記述している．
Octave-forge ソースコード octave-forge-bundle-200900607.tar.gz を /tmp に解凍
cd /tmp tar -xvzof octave-forge-bundle-200900607.tar.gz
.octaverc の設定
ホームディレクトリに，ファイル「.octaverc」を作成しておく．下記の「pkg install ...」の実行時に「UINT_64_C was not declared in this scope」のようなエラーが出ることを防ぐために、下記の設定を行う．
```
setenv("CFLAGS", "-D__STDC_CONSTANT_MACROS");
setenv("CXXFLAGS", "-D__STDC_CONSTANT_MACROS");
```

インストール

(方針)

octave を起動し，「pkg install ...」でインストールする．
octave-forge-bundle-20090607.tar.gz を使う。但し、新しいパッケージについては、「pkg install -global -forge ・・・」でインストールする
パッケージ間の依存関係があるので、下のようなシェルスクリプトを作り、インストールを3回繰り返すことにする

参考 Web ページ https://www.gnu.org/software/octave/doc/interpreter/Installing-and-Removing-Packages.html

cd /tmp
ldconfig 
tar -xvzof /tmp/octave-forge-bundle-20090607.tar.gz
# 不要なパッケージの削除
for i in time-2.0.0 financial-0.4.0 communications-1.1.1 ncArray-1.0.0 splines-1.1.0 issa-0.1.2 mechanics-1.2.1 data-smoothing-1.3.0 strings-1.1.0 quaternion-2.0.0 specfun-1.1.0 dicom-0.1.1 geometry-1.5.0 queueing-1.1.0 NaN-2.5.5 actuarial-1.1.0 bim-1.0.1 control-2.3.53 dataframe-0.9.1 econometrics-1.0.8 es-0.0.4 fenv-0.1.0 fits-1.0.2 fl-core-1.0.0 fpl-1.3.1 ga-0.10.0 general-1.3.2 generate_html-0.1.3 gnuplot-1.0.1 gpc-0.1.7 image-1.0.14 io-1.0.19 java-1.2.9 linear-algebra-2.2.0 miscellaneous-1.1.0 msh-1.0.2 nan-2.4.1 nlwing2-1.2.0 nnet-0.1.13 nurbs-1.3.3 ocs-0.1.3 octcdf-1.1.5 octgpr-1.2.0 octproj-1.1.0 ode-1.0.1 odepkg-0.6.12 openmpi_ext-1.1.0 optim-1.2.0 optiminterp-0.3.3 parallel-2.0.6 plot-1.0.8 pt_br-1.0.9 signal-1.1.3 sockets-1.0.8 specfun-1.0.9 statistics-1.1.3 struct-1.0.10 tsa-4.2.4 vrml-1.0.13 fuzzy-logic-toolkit-0.4.1; do A=${i/-*}; rm -f /tmp/octave-forge-bundle-20090607/main/${A}*; rm -f /tmp/octave-forge-bundle-20090607/extra/${A}* ; done
# repeat 3 times
# 1 回目だけは「-nodeps 」付き
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/main/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -nodeps -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
# octave forge bundle-20090607 が古いので、
# 必要なものを拾う作業が残っている
for i in time-2.0.0 financial-0.4.0 communications-1.1.1 ncArray-1.0.0 splines-1.1.0 issa-0.1.2 mechanics-1.2.1 data-smoothing-1.3.0 strings-1.1.0 quaternion-2.0.0 specfun-1.1.0 dicom-0.1.1 geometry-1.5.0 queueing-1.1.0 NaN-2.5.5 actuarial-1.1.0 bim-1.0.1 control-2.3.53 dataframe-0.9.1 econometrics-1.0.8 es-0.0.4 fenv-0.1.0 fits-1.0.2 fl-core-1.0.0 fpl-1.3.1 ga-0.10.0 general-1.3.2 generate_html-0.1.3 gnuplot-1.0.1 gpc-0.1.7 image-1.0.14 io-1.0.19 java-1.2.9 linear-algebra-2.2.0 miscellaneous-1.1.0 msh-1.0.2 nan-2.4.1 nlwing2-1.2.0 nnet-0.1.13 nurbs-1.3.3 ocs-0.1.3 octcdf-1.1.5 octgpr-1.2.0 octproj-1.1.0 ode-1.0.1 odepkg-0.6.12 openmpi_ext-1.1.0 optim-1.2.0 optiminterp-0.3.3 parallel-2.0.6 plot-1.0.8 pt_br-1.0.9 signal-1.1.3 sockets-1.0.8 specfun-1.0.9 statistics-1.1.3 struct-1.0.10 tsa-4.2.4 vrml-1.0.13 fuzzy-logic-toolkit-0.4.1; do echo $i; echo "pkg install -nodeps -global -forge `echo $i | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/extra/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -nodeps -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
# 2
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/main/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
for i in time-2.0.0 financial-0.4.0 communications-1.1.1 ncArray-1.0.0 splines-1.1.0 issa-0.1.2 mechanics-1.2.1 data-smoothing-1.3.0 strings-1.1.0 quaternion-2.0.0 specfun-1.1.0 dicom-0.1.1 geometry-1.5.0 queueing-1.1.0 NaN-2.5.5 actuarial-1.1.0 bim-1.0.1 control-2.3.53 dataframe-0.9.1 econometrics-1.0.8 es-0.0.4 fenv-0.1.0 fits-1.0.2 fl-core-1.0.0 fpl-1.3.1 ga-0.10.0 general-1.3.2 generate_html-0.1.3 gnuplot-1.0.1 gpc-0.1.7 image-1.0.14 io-1.0.19 java-1.2.9 linear-algebra-2.2.0 miscellaneous-1.1.0 msh-1.0.2 nan-2.4.1 nlwing2-1.2.0 nnet-0.1.13 nurbs-1.3.3 ocs-0.1.3 octcdf-1.1.5 octgpr-1.2.0 octproj-1.1.0 ode-1.0.1 odepkg-0.6.12 openmpi_ext-1.1.0 optim-1.2.0 optiminterp-0.3.3 parallel-2.0.6 plot-1.0.8 pt_br-1.0.9 signal-1.1.3 sockets-1.0.8 specfun-1.0.9 statistics-1.1.3 struct-1.0.10 tsa-4.2.4 vrml-1.0.13 fuzzy-logic-toolkit-0.4.1; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `echo $i | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/extra/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
# 3
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/main/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
for i in time-2.0.0 financial-0.4.0 communications-1.1.1 ncArray-1.0.0 splines-1.1.0 issa-0.1.2 mechanics-1.2.1 data-smoothing-1.3.0 strings-1.1.0 quaternion-2.0.0 specfun-1.1.0 dicom-0.1.1 geometry-1.5.0 queueing-1.1.0 NaN-2.5.5 actuarial-1.1.0 bim-1.0.1 control-2.3.53 dataframe-0.9.1 econometrics-1.0.8 es-0.0.4 fenv-0.1.0 fits-1.0.2 fl-core-1.0.0 fpl-1.3.1 ga-0.10.0 general-1.3.2 generate_html-0.1.3 gnuplot-1.0.1 gpc-0.1.7 image-1.0.14 io-1.0.19 java-1.2.9 linear-algebra-2.2.0 miscellaneous-1.1.0 msh-1.0.2 nan-2.4.1 nlwing2-1.2.0 nnet-0.1.13 nurbs-1.3.3 ocs-0.1.3 octcdf-1.1.5 octgpr-1.2.0 octproj-1.1.0 ode-1.0.1 odepkg-0.6.12 openmpi_ext-1.1.0 optim-1.2.0 optiminterp-0.3.3 parallel-2.0.6 plot-1.0.8 pt_br-1.0.9 signal-1.1.3 sockets-1.0.8 specfun-1.0.9 statistics-1.1.3 struct-1.0.10 tsa-4.2.4 vrml-1.0.13 fuzzy-logic-toolkit-0.4.1; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `echo $i | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/extra/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" |  octave; done
# update
echo "pkg update -global" | octave

(オプション) パッケージの追加

「pkg install -global -forge ...」を使って簡単に追加できる．

for i in NaN-2.0.4 actuarial-1.1.0 bim-1.0.1 control-2.1.53 dataframe-0.8.2 econometrics-1.0.8 es-0.0.4 fenv-0.1.0 fits-1.0.1 fl-core-1.0.0 fpl-1.2.0 ga-0.9.8 general-1.2.2 generate_html-0.1.3 gnuplot-1.0.1 gpc-0.1.7 image-1.0.14 io-1.0.14 java-1.2.7 linear-algebra-2.0.0 miscellaneous-1.0.11 msh-1.0.2 nan-2.4.1 nlwing2-1.2.0 nnet-0.1.13 nurbs-1.3.3 ocs-0.1.1 octcdf-1.1.2 octgpr-1.2.0 octproj-1.0.2 ode-1.0.1 odepkg-0.6.12 openmpi_ext-1.0.2 optim-1.0.16 optiminterp-0.3.3 parallel-2.0.5 plot-1.0.8 pt_br-1.0.9 signal-1.0.11 sockets-1.0.7 specfun-1.0.9 statistics-1.0.10 struct-1.0.9 tsa-4.1.0 vrml-1.0.11 fuzzy-logic-toolkit-0.2.3; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `echo $i | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" | sudo octave; done

(オプション) 最新版に更新

「pkg install -global -forge ...」を使って簡単に更新できる．

for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/main/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" | sudo octave; done
for i in /tmp/octave-forge-bundle-20090607/extra/*.tar.gz; do echo $i; echo "pkg install -global -forge `basename $i .tar.gz | sed 's/\-[0-9\.]*//g'`" | sudo octave; done

インストールされたパッケージの確認
テスト実行
ためしに、video パッケージの機能を使って，avi 形式の動画ファイルの読み込みと、フレーム100番の表示を行ってみる．（OpenCV に付属の avi ファイルを使っています）
pkg load video img = aviread("/usr/local/share/opencv/samples/c/tree.avi", 100); imshow(img);

※ （参考情報）個別のパッケージのインストール方法

なお，octave の「pkg install」だとエラーメッセージが分かりにくいので，エラーが出るけど原因が分からないという場合，下記のようなコマンドを実行して，エラーの有無を確認するという方法もあります．

cd main
tar -xvzof image-1.0.10.tar.gz
cd image-1.0.10
cd src
sh autogen.sh
CFLAGS="-I/usr/local/include/octave-3.6.2 -I/usr/local/include" LDFLAGS="-L/usr/local/lib/octave-3.6.2 -L/usr/local/lib" LIBS="-lavcodec -lavdevice -lavutil -lavformat -lswscale -lpng12 -lm" ./configure
make LIBS="-lavcodec -lavdevice -lavutil -lavformat -lswscale -lpng12 -lm"
make install

性能測定の例

Octave をパッケージを用いてインストール: Octave 3.2.4 をパッケージを用いてインストール
ATLAS 3.8.4 のパッケージ: ATLAS 3.8.4 をパッケージを用いてインストール. Octave 3.6.2 をビルド（本ページの手順）
ATLAS 3.9.81 をビルド: ATLAS 3.9.81 をソースコードからビルドしてインストール. Octave 3.6.2 をビルド（本ページの手順）
Intel MKL: Intel MKL をインストール. Octave 3.6.2 をビルド・インストール（本ページの手順）

			1. Octave をパッケージを用いてインストール	2. ATLAS 3.8.4 のパッケージ	3. ATLAS 3.9.81 をビルド	4. Intel MKL
(a)	行列と行列の積	*X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = X Y**	1.25 sec	1.23 sec	0.30 sec	0.188 sec
(b)	LU 分解 (LU decomposition)	X = rand(2000,2000); [L, U, P] = lu(X)	0.67 sec	0.70 sec	0.31 sec	0.181 sec
(c)	正方行列の逆行列	X = rand(2000,2000); [Z, RCOND] = inv(X)	1.72 sec	1.75 sec	0.58 sec	0.30 sec
(d)	行列式 (determinant)	X = rand(2000,2000); [D, RCOND] = det(X)	0.63 sec	0.65 sec	0.25 sec	0.118 sec
(e)	Singular Value Decomposition (SVD), X = USV	X = rand(2000,2000); [U, S, V] = svd(X)	72 sec	72 sec	70 sec	5.7 sec
(f)	QR factorization	X = rand(2000,2000); [Q, R, P] = qr(X)	4.2 sec	4.2 sec	1.80 sec	1.52 sec
(g)	分散共分散行列	X = rand(2000,2000), Y = rand(2000,2000); Z = cov(X, Y)	1.34 sec	1.27 sec	0.32 sec	0.23 sec
(h)	分散共分散行列の固有値と固有ベクトル（主成分分析）	X = rand(2000,2000); [v, L] = eig( cov(X) )	13.3 sec	13.2 sec	13.7 sec	2.1 sec
(i)	2次元の畳み込み（コンボリューション）	X = rand(2000,2000); B = rand(21); Z = conv2(X, B, 'full')	4.1 sec	1.26 sec	0.73 sec	0.42 sec
(j)	2次元の高速フーリエ変換 (FFT)	X = rand(2000,2000); Z = fft2(X, 2000, 2000)	0.105 sec	0.090 sec	0.098 sec	0.092 sec
(k)	convex hull	x = rand(1000000,1); y = rand(1000000,1); H = convhull(x, y)	0.51 sec	0.115 sec	0.126 sec	0.114 sec

ハードウェア
- CPU: Intel(R) Core(TM) i7-3770K CPU @ 3.50GHz
ソフトウェア
- OS: Ubuntu 12.04 64 bit
- Octave バージョン 3.2.4 (1. Octave をパッケージを用いてインストール) または Octave バージョン 3.6.2 (「1. パッケージを用いてインストール」以外全て)

【お断り】プログラムのテストを行っていない．他のプロセスを止めるなどしていない（従って，比較ではなく，傾向を見るための参考値だと思ってください）．※ 単位は秒で，３桁目を四捨五入．

「2. ATLAS 3.8.4 のパッケージ」の実測値の例

ATLAS 3.8.4 をパッケージを用いてインストール. Octave 3.6.2 をビルド（本ページの手順）

(a) 行列と行列の積: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = X * Y

(b) LU 分解 (LU decomposition): X = rand(2000,2000); [L, U, P] = lu(X)

(d) 行列式 (determinant): X = rand(2000,2000); [D, RCOND] = det(X)

(e) Singular Value Decomposition (SVD), X = U*S*V: X = rand(2000,2000); [U, S, V] = svd(X)

(f) QR factorization (QR decomposition ともいう): X = rand(2000,2000); [Q, R, P] = qr(X)

(g) 分散共分散行列: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = cov(X, Y)

(h) 分散共分散行列の固有値と固有ベクトル（主成分分析）: X = rand(2000,2000); [v, L] = eig( cov(X) )

(i) 2次元の畳み込み（コンボリューション）: X = rand(2000,2000); B = rand(21); Z = conv2(X, B, 'full')

(j) 2次元の高速フーリエ変換 (FFT): X = rand(2000,2000); Z = fft2(X, 2000, 2000)

(k) convex hull: x = rand(1000000,1); y = rand(1000000,1); H = convhull(x, y)

「3. ATLAS 3.9.81 をビルド」の実測値の例

ATLAS 3.9.81 をソースコードからビルドしてインストール. Octave 3.6.2 をビルド（本ページの手順）

(a) 行列と行列の積: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = X * Y

(b) LU 分解 (LU decomposition): X = rand(2000,2000); [L, U, P] = lu(X)

(d) 行列式 (determinant): X = rand(2000,2000); [D, RCOND] = det(X)

(e) Singular Value Decomposition (SVD), X = U*S*V: X = rand(2000,2000); [U, S, V] = svd(X)

(f) QR factorization (QR decomposition ともいう): X = rand(2000,2000); [Q, R, P] = qr(X)

(g) 分散共分散行列: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = cov(X, Y)

(h) 分散共分散行列の固有値と固有ベクトル（主成分分析）: X = rand(2000,2000); [v, L] = eig( cov(X) )

(i) 2次元の畳み込み（コンボリューション）: X = rand(2000,2000); B = rand(21); Z = conv2(X, B, 'full')

(j) 2次元の高速フーリエ変換 (FFT): X = rand(2000,2000); Z = fft2(X, 2000, 2000)

(k) convex hull: x = rand(1000000,1); y = rand(1000000,1); H = convhull(x, y)

「4. Intel MKL」での実測値の例

Intel MKL をインストール. Octave 3.6.2 をビルド・インストール（本ページの手順）

【実測値の例】

(a) 行列と行列の積: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = X * Y

(b) LU 分解 (LU decomposition): X = rand(2000,2000); [L, U, P] = lu(X)

(d) 行列式 (determinant): X = rand(2000,2000); [D, RCOND] = det(X)

(e) Singular Value Decomposition (SVD), X = U*S*V: X = rand(2000,2000); [U, S, V] = svd(X)

(f) QR factorization (QR decomposition ともいう): X = rand(2000,2000); [Q, R, P] = qr(X)

(g) 分散共分散行列: X = rand(2000,2000); Y = rand(2000,2000); Z = cov(X, Y)

(h) 分散共分散行列の固有値と固有ベクトル（主成分分析）: X = rand(2000,2000); [v, L] = eig( cov(X) )

(i) 2次元の畳み込み（コンボリューション）: X = rand(2000,2000); B = rand(21); Z = conv2(X, B, 'full')

(j) 2次元の高速フーリエ変換 (FFT): X = rand(2000,2000); Z = fft2(X, 2000, 2000)

(k) convex hull: x = rand(1000000,1); y = rand(1000000,1); H = convhull(x, y)