ImageJ 1.53 のインストール（Ubuntu 上）

ImageJ は，下記の機能をもったオープンソースの Java のソフトウェア

ファイル読み書き: Anaylze, TIFF, raw, GIF, JPEG, BMP, PNG, PGM, FITS など多数（プラグインの追加インストールにより種類が増える）
画像表示
選択：　領域指定，線，点
画像フィルタ：スムーシング (smoothing), 鋭敏化 (sharpening), エッジ検出 (edge detection), メディアン・フィルタ (median filtering), しきい値処理，対話的な輝度とコントラストの調整
幾何演算：切り出し (crop), サイズ変更 (resize), 回転 (rotate), フリップ (flip)
解析：選択領域の面積，平均、標準偏差、最小、最大．　長さ．角度．密度尺度を用いた調整．ヒストグラム
編集：カット，コピー，ペースト，AND, OR, NOT．テキスト，矢印，矩形，楕円，多角形の描画
色処理： RGB成分，HSV 成分、カラーパレット

など

ImageJ のインストール手順（Windows 上）

ImageJ のページを確認する．
https://imagej.nih.gov/ij/index.html (このページは公開停止になったようです)
「Download」をクリック
Linux の下の「ImageJ bundled with 64-bit Java 8」をクリック
ダウンロードが始まる．
ダウンロードした .zip ファイルを展開（解凍）する．
/tmp にダウンロードしたとする．
次のように操作する．
cd /usr/local sudo unzip /tmp/ij153-linux64-java8.zip
試しに起動してみる
次のように操作する．
cd /usr/local cd ImageJ java -jar ij.jar