データフレーム形式の R システム付属データセット

前準備

使用するソフトウェア

• R システムのインストールが済んでいること

• SQLite 3 のインストール: SQLite 3インストール，データベース作成，テーブル定義，レコード挿入（Windows 上）別ページ »で説明している．

あらかじめ決めておく事項

このページでは，データベースの作成を行いますので， 作成するデータベースのデータベース名を決めておくこと． このページでは，次のように書く．

• データベース名: opendata

  データベース名は，自由に決めてよいが，半角文字（つまり英字と英記号）を使い，スペースを含まないこと，

メタデータのテーブル定義

「メタデータのテーブル定義，meta2sql.rb プログラム, R の Iris データセット」 の記述通りに行う

diamonds (R システムのデータセット)

1. R システムの diamonds データセットを /tmp/diamonds.csv にエクスポート

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   # generate CSV
   cat >/tmp/a.$$.r <<-RCOMMAND
     require(data.table)
     require(ggplot2)
     data.table(diamonds)
     str(diamonds)
     write.csv(diamonds, file="/tmp/diamonds.csv", row.names=FALSE)
   RCOMMAND
   cat /tmp/a.$$.r | r
   head /tmp/diamonds.csv
   

   

2. メタデータの格納
   • diamonds(carat, cut, color, clarity, depth, table, price, x, y, z)

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   rm -f /tmp/a.$$.csv
   cat >/tmp/a.$$.csv <<-METADATA
   diamonds,  1, carat,   real,    ordered, 
   diamonds,  2, cut,     text,    ordered-categorical, 
   diamonds,  3, color,   text,    ordered-categorical, 
   diamonds,  4, clarity, text,    ordered-categorical, 
   diamonds,  5, depth,   real,    ordered, 
   diamonds,  6, tbl,     real,    ordered, 
   diamonds,  7, price,   integer, ordered, 
   diamonds,  8, x,       real,    ordered, 
   diamonds,  9, y,       real,    ordered, 
   diamonds, 10, z,       real,    ordered, 
   METADATA
   
   #
   cat >/tmp/a.$$.sql <<-SQL
   .mode csv
   .import /tmp/a.$$.csv metadata
   vacuum; 
   SQL
   #
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   # 
   echo "select * from metadata where table_name = 'diamonds';" | sqlite3 /tmp/opendata
   

   

3. テーブル定義

   /tmp/meta2sql.rb を使用し、テーブル定義 SQL プログラムを生成し実行する

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   echo 'drop table diamonds; ' > /tmp/a.$$.sql
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   ruby /tmp/meta2sql.rb /tmp/opendata metadata diamonds | tee /tmp/a.$$.sql
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   

   

4. テーブルの作成

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   # import table data
   cat >/tmp/a.$$.sql <<-SQL
   .mode csv
   .import /tmp/a.$$.csv diamonds
   vacuum; 
   SQL
   #
   tail -n +2 /tmp/diamonds.csv > /tmp/a.$$.csv
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   # 
   echo 'select * from diamonds limit 10;' | sqlite3 /tmp/opendata
   

   

Indometh (R システムのデータセット)

1. R システムの Indometh データセットを /tmp/Indometh.csv にエクスポート

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   # generate CSV
   cat >/tmp/a.$$.r <<-RCOMMAND
     require(data.table)
     require(datasets)
     data.table(Indometh)
     str(Indometh)
     write.csv(Indometh, file="/tmp/Indometh.csv", row.names=FALSE)
   RCOMMAND
   cat /tmp/a.$$.r | r
   head /tmp/Indometh.csv
   

   

2. メタデータの格納
   • Indometh(Subject, t, conc)

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   rm -f /tmp/a.$$.csv
   cat >/tmp/a.$$.csv <<-METADATA
   Indometh,  1,  Subject,  integer,  categorical, 
   Indometh,  2,  t,        real,     ordered, 
   Indometh,  3,  conc,     real,     ordered,  
   METADATA
   
   #
   cat >/tmp/a.$$.sql <<-SQL
   .mode csv
   .import /tmp/a.$$.csv metadata
   vacuum; 
   SQL
   #
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   # 
   echo "select * from metadata where table_name = 'Indometh';" | sqlite3 /tmp/opendata
   

   

3. テーブル定義

   /tmp/meta2sql.rb を使用し、テーブル定義 SQL プログラムを生成し実行する

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   echo 'drop table Indometh; ' > /tmp/a.$$.sql
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   ruby /tmp/meta2sql.rb /tmp/opendata metadata Indometh | tee /tmp/a.$$.sql
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   

   

4. テーブルの作成

   ◆ bash プログラム

   #!/bin/bash
   # import table data
   cat >/tmp/a.$$.sql <<-SQL
   .mode csv
   .import /tmp/a.$$.csv Indometh
   vacuum; 
   SQL
   #
   tail -n +2 /tmp/Indometh.csv > /tmp/a.$$.csv
   cat /tmp/a.$$.sql | sqlite3 /tmp/opendata
   # 
   echo 'select * from Indometh limit 10;' | sqlite3 /tmp/opendata