![[kaneko lab.]](https://www.kkaneko.jp/info/logo_png.png){kind=logo}
FreeBSD でプログラミング環境を整える（ポーツ・コレクションを使用）（書きかけ）
FreeBSD に種々のソフトウェアのインストールする
【目次】
- 基本ツール
- エディタ: emacs, vim, gnotepad+, beav
- インターネット: firefox, chromium, filezilla
- デスクトップユーティリティ: shutter
- 画像: ImakeMagick, OSGeo4W 相当, gdal
- 3次元グラフィックス: Blender, MeshLab
- ビデオ: vlc, OpenShot
- プログラミング
- Python 開発環境 (jupyter, spyder), Python パッケージ
- R システム, R 開発環境, R パッケージ
- データベース管理システム: SQLite 3, DB Browser for SQLite, sqliteman
- ツール、ライブラリ: CUDA, cuDNN, git, make, cmake, swig
- 種々のアプリケーション
- プログラミング言語と開発環境: Java, Eclipse EE, Octave, Ruby ...shutdi
基本ツール
端末を開き，次のコマンドを実行
cd /usr/ports/editors/emacs
make install
pkg lock editors/emacs
cd /usr/ports/editors/vim
make install
pkg lock editors/vim
cd /usr/ports/editors/gnotepad+
make install
pkg lock editors/gnotepad+
cd /usr/ports/editors/beav
make install
pkg lock editors/beav
cd /usr/ports/www/firefox-i18n
make install
pkg lock www/firefox-i18n
cd /usr/ports/www/chromium
make install
pkg lock www/chromium
cd /usr/ports/ftp/filezilla
make install
pkg lock ftp/filezilla
cd /usr/ports/deskutils/shutter
make install
pkg lock deskutils/shutter
cd /usr/ports/graphics/blender
make install
pkg lock graphics/blender
cd /usr/ports/cad/meshlab
make install
pkg lock cad/meshlab
cd /usr/ports/multimedia/vlc
make install
pkg lock multimedia/vlc
cd /usr/ports/devel/git
make install
pkg lock devel/git
cd /usr/ports/devel/cmake
make install
pkg lock devel/cmake
cd /usr/ports/databases/sqlite3
make install
pkg lock databases/sqlite3
cd /usr/ports/databases/sqliteman
make install
pkg lock databases/sqliteman
cd /usr/ports/java/eclipse
make install
pkg lock java/eclipse
◇ パッケージを活用してインストールするもの
- JDK
- GNU の エディタ emacs, tamago (emacs でのかな漢字変換用), yatex
- GNU の 開発用ツール類: gmake, patch
- GNU の その他の開発用ツール類 (autoconf, automake, autogen, bison, gawk, libtool, ccache, binutils)
- GNU の コンパイラ (gcc42, gcc44, g++44, gfortran44, gcc45, g++45, gfortran45, gcc46, g++46, gfortran46)
- ライブラリ類(readline, openssl, gmp, mpfr, ppl, mpc, metis, suitesparse, glpk, gsl, fltk）
- lapack
- 表示，変換など (freetype2, xpdf, nkf, lv, xlhtml, libgsf, wv2)
- Chasen
- Namazu
- MySQL-client
- SDL, グラフィックス (SDL12, ImageMagick, GraphicsMagick, libjpeg, libpng, libtiff）
- パノラマ画像ツール (autopano-sift, hugin, panoglview), avbin
- ffmpeg, avbin
- cmake
- vtk
- OpenCV
- irrlicht (3D ゲームエンジン)
- wxWidgets
- tcl/tk 処理系
- blender
- Ogre3d, ember
- octave 処理系
- R 処理系
- Ruby, RubyGems, eRuby, erubis, Ruby on Rails, Ruby GNOME2, Ruby Facets, Ruby RMagick, Ruby mysql, Ruby sqlite3, Apache mod_ruby
- NetBeans IDE
- Sqlite3, spatialize, sqlite-ext-miscfuncs, sqlite-ext-mobigourp, sqliteman
- beav (バイナリエディタ)
- VNC, vino, rdesktop, tsclient など
◇ ソースコードからビルドするもの
* Ubuntu については別ページで説明
* 参考ファイル: hoge5.sh
* この Web ページでインストール手順を説明していない主要なソフトウェア
- Eclipse を FreeBSD にインストール（リンク先で詳しく説明）
- Octave を FreeBSD にインストール（リンク先で詳しく説明）
- Octave-Forge を FreeBSD にインストール（リンク先で詳しく説明）
- FreeBSD に SQLite Analyzer をダウンロードしテスト実行（リンク先で詳しく説明）
前準備
システムの更新
「FreeBSD システムの更新，ポーツコレクションの維持更新」 のページを参考に，次のことを行っておく．
- FreeBSD のセキュリティパッチ
- ポーツ・コレクション(ports collection) のダウンロード，アップデート（更新）
Java 開発環境 JDK のインストール
前準備として， 「FreeBSD Foundation 版 Java を FreeBSD にインストール」の Web ページを参考にインストールを行っておく．
* 前準備
ダウンロード http://www.freebsdfoundation.org/
* インストール手順の詳細
* インストール操作を記述したスクリプト (FreeBSD 用)
cd /usr/ports/java/diablo-jdk16
make config
make clean deinstall
make -j4
make install
portsdb -u
emacs のインストール (パッケージを使用)
pkg_add -r emacs
pkg_add -r tamago-emacs23
pkg_add -r ja-scim-anthy
pkg_add -r ja-uim-anthy
pkg_add -r ja-anthy
pkg_add -r yatex
種々のソフトウェアのインストール (パッケージを使用)
pkg_add -r gmake
pkg_add -r patch
pkg_add -r autoconf262
pkg_add -r automake110
pkg_add -r autogen
pkg_add -r bison
pkg_add -r gawk
pkg_add -r libtool
pkg_add -r ccache
pkg_add -r binutils
pkg_add -r readline
pkg_add -r openssl
pkg_add -r gmp
pkg_add -r mpfr
pkg_add -r ppl
pkg_add -r mpc
pkg_add -r metis
pkg_add -r suitesparse
pkg_add -r glpk
pkg_add -r gsl
pkg_add -r fltk
# GNU コンパイラコレクション・バージョン 4.4 / 4.5 / 4.6 のインストール
pkg_add -r gcc42
pkg_add -r gcc44
pkg_add -r gcc46
pkg_add -r gcc45
pkg_add -r libstdc++_stldoc_4.2.2
#
pkg_add -r lapack
# 表示，変換など
pkg_add -r freetype2
pkg_add -r xpdf
pkg_add -r ja-nkf
pkg_add -r lv
pkg_add -r xlhtml
pkg_add -r libgsf
pkg_add -r wv2
# Japanse Morphological Analyis
pkg_add -r ja-chasen
pkg_add -r ja-chasen-base
pkg_add -r ja-p5-Text-ChaSen
pkg_add -r ja-ruby18-chasen
pkg_add -r ruby18-gyokuro
pkg_add -r ja-ipadic
pkg_add -r ja-mecab
pkg_add -r ja-mecab-ipadic
pkg_add -r ruby-mecab
# full text search
pkg_add -r ja-namazu2
pkg_add -r ruby18-search-namazu
pkg_add -r ja-rbnamazu
# データベースクライアントライブラリ
pkg_add -r mysql55-client
# SDL
pkg_add -r sdl
# graphics
pkg_add -r ImageMagick
pkg_add -r GraphicsMagick
pkg_add -r jpeg
pkg_add -r png
pkg_add -r tiff
# panoramic image
pkg_add -r autopano-sift
pkg_add -r hugin
pkg_add -r panoglview
# ffmpeg
pkg_add -r ffmpeg
pkg_add -r avbin
# vtk
pkg_add -r cmake
pkg_add -r vtk
pkg_add -r vtk-data
pkg_add -r vtk-examples
pkg_add -r vtk-headers
pkg_add -r vtk-java
# OpenCV
pkg_add -r opencv
# irrlicht (3D ゲームエンジン)
pkg_add -r irrlicht
# wxWidgets
pkg_add -r wxgtk28
pkg_add -r wxgtk28-contrib
# tcl/tk 処理系
pkg_add -r tcl85
pkg_add -r tclX
pkg_add -r tk85
# blender
pkg_add -r blender
pkg_add -r blender-doc
# Ogre3d, ember
pkg_add -r ogre3d
pkg_add -r ember
# octave 処理系
pkg_add -r octave
# R 処理系
pkg_add -r R
# OpenOffice.org
portupgrade -Npv -B 'make rmconfig' editors/openoffice.org-3
# git (Distributed source code management system)
pkg_add -r git
pkg_add -r giggle
pkg_add -r gitg
# virutal machine tools (仮想マシンツール)
# ubuntu-vm-builder (skip on FreeBSD)
# virt-manager (skip on FreeBSD)
# virt-viewer (skip on FreeBSD)
pkg_add -r openssh-askpass
pkg_add -r qemu
pkg_add -r qemu-launcher
# wine エミュレータ
pkg_add -r wine
pkg_add -r wine-doors
# Network security
pkg_add -r nmap
pkg_add -r umit
pkg_add -r knmap
pkg_add -r klamav
# password security (パスワードセキュリティ)
pkg_add -r medusa
pkg_add -r aricrack-ng
# system information and device management (システムに関する情報の取得)
# gnome-device-manager (skip on FreeBSD)
pkg_add -r sysinfo
pkg_add -r xprobe
pkg_add -r p0f
pkg_add -r satellite
# remote connection and file transfer, (リモート接続とファイル転送) VNC, vino, rdesktop, tsclient, filezilla
pkg_add -r filezilla
pkg_add -r x11vnc
pkg_add -r vino
pkg_add -r rdesktop
pkg_add -r tsclient
# file tools, launcher (ファイル操作ツール, ランチャー)
pkg_add -r gnome-commander2
# i386 用のデコーダ (decoders for i386) (only FreeBSD)
pkg_add -r win32-codecs
# バイナリエディタ, スクリーンショット，ペイント, 図，グラフ，スペルチェック，改行，ポストスクリプト，TeX 支援，scror, gwenview，動画像
pkg_add -r beav
pkg_add -r scrot
pkg_add -r gwenview
pkg_add -r mplayer
pkg_add -r smplayer
pkg_add -r avidemux2
pkg_add -r dia
pkg_add -r tgif
pkg_add -r qgfe
pkg_add -r ispell
pkg_add -r unix2dos
pkg_add -r a2ps
pkg_add -r pstotext
Ruby 処理系と SQLite 3 関係のインストール (パッケージを使用)
# Sqlite3, sqliteman, Apache mod_ruby
pkg_add -r sqlite3
pkg_add -r spatialite
pkg_add -r sqlite-ext-inet
pkg_add -r sqlite-ext-miscfuncs
pkg_add -r sqlite-ext-mobigroup
pkg_add -r sqliteman
pkg_add -r mod_ruby
# Ruby
pkg_add -r ruby18-pdflib
pkg_add -r ruby
#
pkg_add -r ruby18-extensions
pkg_add -r ruby18-gems
pkg_add -r eruby
pkg_add -r rubygem-erubis
#
pkg_add -r netbeans
gem update --system
pkg_add -r rubygem-rails
pkg_add -r rubygem-rails-app-installer
pkg_add -r gnome-doc-utils
pkg_add -r ruby18-panelapplet
pkg_add -r ruby18-gnome2
pkg_add -r rubygem-facets
pkg_add -r ruby18-rmagick
pkg_add -r ruby18-mysql
pkg_add -r rubygem-sqlite3
pkg_add -r ruby18-wirble
pkg_add -r rubygem-gruff
cd /usr/lib/ruby/gems/1.8/gems/octave-ruby-1.0.9 ・・・ この部分は書きかけ（うまくいかない）
ruby setup.rb ・・・ この部分は書きかけ（うまくいかない）
pkg_add -r beav
# VNC, rdesktop, vncviewer
pkg_add -r vnc
pkg_add -r vino
pkg_add -r rdesktop
pkg_add -r tsclient
再び前準備
【注意】下記に挙げるソフトウェアの多くはフリーソフトウェアではない（ある限られた条件下でのみ，無償で使うことが許されているだけ）．
ライセンス条項は各自で確認すること。 再配布は不可 などの決まりがそれぞれあるので、ライセンス条項をよく確認もせずにソースコードを再配布したり、知り合いのパソコンに代理でインストールしたり、などを避けておく（よくライセンス条項を確認）。
それぞれのインストールの前準備として， ソースコードを入手しておく。 入手先は、それぞれ、下記に記述している。
GotoBLAS2 バージョン 1.13 のインストール (ソースコードからビルド)
* 前準備
ダウンロード GotoBLAS2-1.13.tar.gz http://www.tacc.utexas.edu/resources/software/
* インストール手順の詳細
https://www.kkaneko.jp/tools/ubuntu/cblaslinux.html
* インストール操作を記述したスクリプト
【特記事項】 FreeBSD では「quickbuild.64bit」を実行するとエラーが出るので，替わりに「gmake BINARY=64 CC="gcc44 -DDTB_ENTRIES=64"」
【特記事項の２】gcc44, gfortran44 を使う
cd /tmp
rm -rf /tmp/GotoBLAS2
tar -xvzof GotoBLAS2-1.13.tar.gz
cd GotoBLAS2
echo ■ Makefile.rule の設定
echo =================================================================
rm -f /tmp/pp
echo '*** Makefile.rule.DIST 2010-07-03 11:40:43.657754091 -0400' > /tmp/pp
echo '--- Makefile.rule 2010-07-03 11:43:38.741566987 -0400' >> /tmp/pp
echo '***************' >> /tmp/pp
echo '*** 14,23 ****' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # C compiler including binary type(32bit / 64bit). Default is gcc.' >> /tmp/pp
echo " # Don't use Intel Compiler or PGI, it won't generate right codes as I expect." >> /tmp/pp
echo '! # CC = gcc' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # Fortran compiler. Default is g77.' >> /tmp/pp
echo '! # FC = gfortran' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # Even you can specify cross compiler' >> /tmp/pp
echo ' # CC = x86_64-w64-mingw32-gcc' >> /tmp/pp
echo '--- 14,23 ----' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # C compiler including binary type(32bit / 64bit). Default is gcc.' >> /tmp/pp
echo " # Don't use Intel Compiler or PGI, it won't generate right codes as I expect." >> /tmp/pp
echo '! CC = gcc44' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # Fortran compiler. Default is g77.' >> /tmp/pp
echo '! FC = gfortran44' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # Even you can specify cross compiler' >> /tmp/pp
echo ' # CC = x86_64-w64-mingw32-gcc' >> /tmp/pp
echo '***************' >> /tmp/pp
echo '*** 30,39 ****' >> /tmp/pp
echo ' # specify it.' >> /tmp/pp
echo ' # For force setting for single threaded, specify USE_THREAD = 0' >> /tmp/pp
echo ' # For force setting for multi threaded, specify USE_THREAD = 1' >> /tmp/pp
echo '! # USE_THREAD = 0' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo " # If you're going to use this library with OpenMP, please comment it in." >> /tmp/pp
echo '! # USE_OPENMP = 1' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # You can define maximum number of threads. Basically it should be' >> /tmp/pp
echo " # less than actual number of cores. If you don't specify one, it's" >> /tmp/pp
echo '--- 30,39 ----' >> /tmp/pp
echo ' # specify it.' >> /tmp/pp
echo ' # For force setting for single threaded, specify USE_THREAD = 0' >> /tmp/pp
echo ' # For force setting for multi threaded, specify USE_THREAD = 1' >> /tmp/pp
echo '! USE_THREAD = 1' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo " # If you're going to use this library with OpenMP, please comment it in." >> /tmp/pp
echo '! USE_OPENMP = 1' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' # You can define maximum number of threads. Basically it should be' >> /tmp/pp
echo " # less than actual number of cores. If you don't specify one, it's" >> /tmp/pp
patch < /tmp/pp
echo =================================================================
gmake BINARY=64 CC="gcc44 -DDTB_ENTRIES=64"
cp *.a /usr/lib
CBLAS のインストール (ソースコードからビルド)
* 前準備
CBLAS のソースコードのダウンロード, http://www.netlib.org/blas/blast-forum/
* インストール手順の詳細
https://www.kkaneko.jp/tools/ubuntu/cblaslinux.html
* インストール操作を記述したスクリプト
【特記事項】 FreeBSD では「gfortran」の替わりに「gfortran44」 gcc44 を使う
cd /tmp
rm -rf /tmp/CBLAS
tar -xvzf cblas.tgz
cd /tmp/CBLAS
ln -s Makefile.LINUX Makefile.in
echo ■ /tmp/CBLAS/Makefile.in の編集
echo =================================================================
rm -f /tmp/pp
echo '*** Makefile.in.DIST 2010-07-03 12:43:34.162601551 -0400' > /tmp/pp
echo '--- Makefile.in 2010-07-03 12:43:42.415691945 -0400' >> /tmp/pp
echo '***************' >> /tmp/pp
echo '*** 22,29 ****' >> /tmp/pp
echo ' # Libraries and includs' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! BLLIB = libblas.a' >> /tmp/pp
echo '! CBDIR = $(HOME)/CBLAS' >> /tmp/pp
echo ' CBLIBDIR = $(CBDIR)/lib/$(PLAT)' >> /tmp/pp
echo ' CBLIB = $(CBLIBDIR)/cblas_$(PLAT).a' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '--- 22,29 ----' >> /tmp/pp
echo ' # Libraries and includs' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! BLLIB = /usr/lib/libgoto2.a -lpthread -lgomp' >> /tmp/pp
echo '! CBDIR = /tmp/CBLAS' >> /tmp/pp
echo ' CBLIBDIR = $(CBDIR)/lib/$(PLAT)' >> /tmp/pp
echo ' CBLIB = $(CBLIBDIR)/cblas_$(PLAT).a' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '***************' >> /tmp/pp
echo '*** 32,46 ****' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! CC = gcc' >> /tmp/pp
echo '! FC = g77' >> /tmp/pp
echo ' LOADER = $(FC)' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' # Flags for Compilers' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! CFLAGS = -O3 -DADD_' >> /tmp/pp
echo '! FFLAGS = -O3 ' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' # Archive programs and flags' >> /tmp/pp
echo '--- 32,46 ----' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! CC = gcc44' >> /tmp/pp
echo '! FC = gfortran44' >> /tmp/pp
echo ' LOADER = $(FC)' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' # Flags for Compilers' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo '! CFLAGS = -m64 -O3 -DADD_' >> /tmp/pp
echo '! FFLAGS = -m64 -O3 ' >> /tmp/pp
echo ' ' >> /tmp/pp
echo ' #-----------------------------------------------------------------------------' >> /tmp/pp
echo ' # Archive programs and flags' >> /tmp/pp
patch < /tmp/pp
echo =================================================================
make all
cd /tmp/CBLAS/lib/LINUX
cp cblas_LINUX.a /usr/lib/libcblas.a
cp /tmp/CBLAS/src/cblas.h /usr/include/cblas.h
ATLAS 3.29.25のインストール (ソースコードからビルド)
* 前準備
◇ ATLAS のソースコードのダウンロード, http://math-atlas.sourceforge.net/
* インストール手順の詳細
https://www.kkaneko.jp/tools/linuxtoolchain/atlaslinux.html
* インストール操作を記述したスクリプト
【特記事項】 FreeBSD では「gfortran」の替わりに「gfortran44」，FreeBSD では「make」の替わりに「gmake」を使う場合がある（全てではない）
* マルチスレッド版ライブラリがうまくビルドできない場合があります(2010/10)
cd /tmp
rm -rf /tmp/ATLAS3.9.25
tar -xvjof atlas3.9.25.tar.bz2
mv ATLAS ATLAS3.9.25
cd ATLAS3.9.25
../configure --prefix=/usr/atlas -Si nof77 1 -C if gfortran44 -C ac gcc44 -Fa alg -fopenmp -Fa alg -fPIC -omp 2 -Ss flapack /tmp/lapack-3.2.2/SRC -Si latune 1
make
make check
make ptcheck
make time
make install
cd lib
make ptshared cptshared
rm -f /usr/atlas/lib/*.so
cp *.so /usr/atlas/lib
rm -f /usr/atlas/lib/liblapack.a
rm -f /usr/atlas/lib/liblapack.so