1次元データのクラスタリング（R, Ckmeans.1d.dp パッケージを使用）

【概要】

Ckmeans.1d.dp パッケージを使い，1次元（univariate，1個の変数からなる）データを対象に，動的計画法により最適なクラスタリングを行う．Ckmeans.1d.dp は k-means によるクラスタリング，Ckmedian.1d.dp は k-median によるクラスタリングを行う関数である．

【目次】

【関連する外部ページ】

https://cran.r-project.org/web/packages/Ckmeans.1d.dp/index.html

第１章　前準備

R システムのインストール

R のプログラミングについては，別のページにまとめている．

第２章　Ckmeans.1d.dp パッケージのインストールと確認

  1. R の起動
  2. install.packages("Ckmeans.1d.dp") の実行 
    if (!require("Ckmeans.1d.dp")) install.packages("Ckmeans.1d.dp")
    初めてパッケージをインストールするときには，次の操作が必要になる．
    1. Windows では，初めて何らかのパッケージをインストールするとき，管理者権限がない場合，ユーザ領域にインストールするという表示が出る．「はい」をクリックする．

      次の表示が出た場合には，「はい」をクリックする．

    2. ミラーサイトは，日本のものを選ぶ．
  3. library(Ckmeans.1d.dp) の実行 
    library(Ckmeans.1d.dp)
  4. サンプルの表示 
    example(Ckmeans.1d.dp)

第３章　ベクトルデータのクラスタリングの例

ここでは，ベクトルデータ iris$Petal.Length をクラスタリングする．iris は，R システムに組み込み済みのデータである．

  1. iris$Petal.Length の確認 
    data(iris)
print(iris$Petal.Length)
  2. Ckmedian.1d.dp によるクラスタリング 
    result = Ckmedian.1d.dp(iris$Petal.Length)
plot(result)

    今度はクラスタ数を指定する． 

    result = Ckmedian.1d.dp(iris$Petal.Length, 3)
plot(result)
  3. Ckmeans.1d.dp によるクラスタリング 
    result = Ckmeans.1d.dp(iris$Petal.Length)
plot(result)

    今度はクラスタ数を指定する． 

    result = Ckmeans.1d.dp(iris$Petal.Length, 3)
plot(result)